人工智能引导的单细胞转录组分析识别类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中O-GlcNAc转移酶作为治疗靶点

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315144

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

类风湿关节炎（RA）是一种慢性自身免疫性疾病，以全身性炎症、滑膜增生以及骨与软骨破坏为特征。尽管使用了多种免疫抑制性改善病情抗风湿药（DMARDs），仍有相当比例的RA患者持续存在症状。随着RA进展，成纤维细胞样滑膜细胞（FLSs）发生表型转变，进入侵袭性状态，使其成为RA治疗中颇具吸引力的非免疫细胞靶点。然而，由于缺乏特异性分子靶点，目前尚无临床上可选择性地清除RA-FLSs的疗法。我们的研究聚焦于敲低RA-FLSs中的OGT和SAP130基因。OGT和SAP130在RA-FLSs细胞中表达，并在其侵袭性转变中发挥关键作用。通过特异性敲除OGT和SAP130，我们观察到RA-FLS的侵袭性转化受到显著抑制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。