GSE311281:应激下细胞非自主性血红素获取通路促进红系血红蛋白化

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个 series matrix 文件,对应高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247

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GSE311281: A cell-nonautonomous heme acquisition pathway enables erythroid hemoglobinization under stress

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

GSE311281:应激下细胞非自主性血红素获取通路促进红系血红蛋白化

A cell-nonautonomous heme acquisition pathway enables erythroid hemoglobinization under stress

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个 series matrix 文件,对应高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。源站描述聚焦应激条件下红系前体细胞通过质膜渗透酶 HRG1 摄取血红素以支持终末红系分化和血红蛋白化,并涉及 HRG1 缺失导致贫血及 β-地中海贫血小鼠模型。数据可用于研究红系分化、应激红系造血及血红素获取相关基因表达变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 24 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):血红素是一种必需的含铁辅因子,通过保守的八步酶促途径在线粒体中合成。过去认为细胞独立管理自身的血红素供应。然而,超过 1,000 种蛋白质参与该辅因子的生产、运输和调控。在终末红系分化过程中,细胞失去线粒体却继续制造血红蛋白,这暗示存在一种非经典的、细胞非自主性的血红素来源。我们发现,在应激条件下,红系前体细胞通过渗透酶 Heme Responsive Gene 1(HRG1)输入血红素,该蛋白定位于质膜并在应激红系造血过程中积累,应激红系造血是响应贫血而在骨髓外加速产生红细胞的过程。HRG1 缺失损害血红素摄取,抑制终末红系分化,并导致贫血。在 β-地中海贫血小鼠中,HRG1 的部分缺失会损害

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311281

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 04 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311281

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血红素是一种必需的含铁辅因子,通过一条保守的八步酶促途径在线粒体中合成。长期以来,人们认为细胞能够独立管理自身的血红素供应。然而,超过1000种蛋白质参与该辅因子的生产、运输和调控。在终末红系分化过程中,细胞失去线粒体却仍能继续合成血红蛋白,这暗示存在一种非经典的、细胞非自主性的血红素来源。我们发现,在应激状态下,红系前体细胞通过透性酶血红素响应基因1(HRG1)输入血红素,该蛋白定位于质膜,并在应激性红细胞生成过程中积累——应激性红细胞生成是响应贫血时在骨髓外加速产生红细胞的过程。HRG1缺失损害了血红素摄取,抑制了终末红系分化,并导致贫血。在β-地中海贫血小鼠中,HRG1的部分缺失改善了无效红细胞生成,凸显了平衡的血红素输入的重要性。这些发现揭示了细胞间血红素共享,并确定HRG1为血红蛋白病的一个潜在治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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