ChemR23在动脉粥样硬化中防止血管平滑肌细胞向巨噬细胞样泡沫细胞表型转换

研究通过骨髓移植构建非造血细胞ChemR23缺陷的Apoe-/-小鼠模型,喂食西方饮食6或12周后,对剥离外膜的主动脉进行bulk RNA测序,发现病变增大、血管平滑肌细胞增殖及泡沫细胞增多,并揭示基因表达变化

geo
浏览 2
基因组分类GPL2424710090
GSE309322: ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage like foam cells in atherosclerosis.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

ChemR23在动脉粥样硬化中防止血管平滑肌细胞向巨噬细胞样泡沫细胞表型转换

ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage like foam cells in atherosclerosis.

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE309322_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序基因表达谱,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。研究通过骨髓移植构建非造血细胞ChemR23缺陷的Apoe-/-小鼠模型,喂食西方饮食6或12周后,对剥离外膜的主动脉进行bulk RNA测序,发现病变增大、血管平滑肌细胞增殖及泡沫细胞增多,并揭示基因表达变化。数据可用于分析ChemR23在动脉粥样硬化中调控血管平滑肌细胞表型转换的转录组特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 26 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:已证明造血细胞ChemR23缺陷可通过增加M2巨噬细胞减少动脉粥样硬化病变,但全身缺陷小鼠中的矛盾结果提示ChemR23具有细胞特异性功能。因此,我们旨在研究ChemR23 particularly在动脉粥样硬化中对血管平滑肌细胞(VSMCs)的作用。方法与结果:通过将载脂蛋白E缺陷骨髓移植到经照射的ChemR23e/e Apoe-/-双缺陷受体小鼠(Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-)中,产生非造血细胞ChemR23缺陷小鼠,喂食西方饮食6或12周。后续分析显示Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-小鼠病变大小增加、VSMC增殖增强和VSMC泡沫细胞增多。对Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-小鼠剥离外膜的主动脉进行bulk RNA测序,暴露基因表达增加

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309322

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 01 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309322

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:研究表明,造血系统ChemR23缺陷可通过增加M2巨噬细胞减少动脉粥样硬化病变,但全身性缺陷小鼠中的矛盾结果提示ChemR23具有细胞特异性功能。因此,我们旨在研究ChemR23在动脉粥样硬化中特别是对血管平滑肌细胞(VSMCs)的作用。方法与结果:通过将载脂蛋白E缺陷骨髓移植入经照射的ChemR23e/e Apoe-/-双缺陷受体小鼠(Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-),构建非造血细胞ChemR23缺陷小鼠,并给予西方饮食喂养6周或12周。后续分析显示,Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-小鼠病变面积增大,VSMC增殖和VSMC泡沫细胞增多。对Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-小鼠去外膜主动脉进行批量RNA测序发现,合成型VSMC标志物如Lgals3和Cd68的基因表达增加,而收缩型基因表达下调。

同样,来自晚期人类动脉粥样硬化斑块的单细胞转录组数据显示,收缩型血管平滑肌细胞(VSMC)中ChemR23表达最高,而合成型VSMC中其表达显著降低。在体外实验中,用ChemR23小分子抑制剂α-NETA处理人主动脉平滑肌细胞(HASMC),可增加合成型基因表达,但下调TGFB、ABCA1、ABCG1和SRB1的表达。此外,α-NETA处理的HASMC下调TGFB分泌,增加胆固醇摄取但减少胆固醇外流,并表现出细胞增殖增强。用ChemR23的真正配体chemerin 9(C9)激动ChemR23对合成型基因表达无影响,但可减轻α-NETA对基因表达、胆固醇摄取、外流和细胞增殖的影响。在体内实验中,对Apoe-/-小鼠进行4周西方饮食(WD)并用α-NETA和C9处理,均显示出治疗潜力。C9减轻总体炎症负担,而α-NETA促进动脉粥样硬化保护性M2巨噬细胞表型。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案