Gimap6缺陷小鼠内皮细胞与巨噬细胞的转录组分析：致死性血管病变机制研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307778

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含为阐明Gimap6缺陷小鼠中观察到的严重血管病变和过早致死性的分子机制而生成的转录组数据。该研究包括对从Gimap6KO和野生型（C57BL/6）小鼠中分离的两种关键细胞类型进行RNA测序（RNA-seq）：主动脉内皮细胞（AECs）：该实验旨在识别导致Gimap6敲除小鼠中观察到的血管屏障完整性受损和内皮功能障碍的转录变化。骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）：该实验旨在确定在缺乏GIMAP6的情况下驱动脂质积累增强和促动脉粥样硬化泡沫细胞形成的基因表达程序。这些数据集的比较分析定义了GIMAP6在维持血管稳态中的细胞内在作用，并为了解一种新型的、非高脂血症依赖性的动脉粥样硬化途径提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。