msbB 敲除对鼠伤寒沙门菌 14028S 基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304712

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

鼠伤寒沙门菌（Salmonella enterica serovar Typhimurium，ST）缺失msbB基因的突变株（ΔmsbB）作为治疗应用中减毒细菌载体的候选者已被广泛研究。msbB的缺失导致脂多糖（LPS）的脂质A酰化不足，从而降低内毒素毒性，同时维持结构完整性。传统上，这种减毒作用被归因于修饰后的脂质A与TLR4之间相互作用减弱，导致TLR4激活降低。在本研究中，我们证实ΔmsbB ST在小鼠脓毒症模型中的致死性低于野生型（WT）ST。然而，这一差异在TLR4和caspase-11缺陷小鼠中依然存在，提示LPS信号传导并非毒力的主要决定因素。在体外实验中，来自TLR4或caspase-11缺陷小鼠的骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）在ST诱导的细胞死亡和细胞因子产生方面仅表现出轻度降低。重要的是，ΔmsbB ST在这些实验中与WT ST表现相似，进一步表明LPS介导的信号传导并非所观察到的减毒作用的核心。

此外，该突变体表现出外膜通透性增加，这可能促成了其抗生素敏感性的增强——以及由于鞭毛蛋白水平降低而导致的运动性减弱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。