叶黄素处理类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞的RNA-Seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301891

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

类风湿关节炎（RA）是一种以滑膜炎症和进行性关节破坏为特征的慢性自身免疫性疾病。尽管叶黄素以其抗氧化和抗炎特性而闻名，但其对RA相关滑膜细胞基因表达的影响仍不清楚。在本研究中，我们采用RNA测序技术研究叶黄素处理的成纤维样滑膜细胞（FLS）的转录组变化。通过基因集富集分析（GSEA）和Ingenuity通路分析（IPA）对差异表达基因进行鉴定和分析，以探索相关的生物学过程和分子网络。结果显示，叶黄素处理改变了参与细胞外基质重塑和炎症的基因表达。富集分析提示叶黄素可调节与RA发病机制相关的信号通路。这些转录组学发现为叶黄素对RA相关滑膜细胞的潜在分子效应提供了见解，并为进一步的功能研究奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。