GSE301409：骨髓微环境中EBF1-ITGB8轴的破坏在临床前模型中减轻骨髓纤维化

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301409

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数据说明

骨髓（BM）微环境的纤维化重塑是骨髓纤维化（MF）的特征性表现，并促进疾病进展。在MF中，间充质基质细胞（MSCs）产生过量炎症细胞因子和细胞外基质，导致BM纤维化和造血功能受损、髓外造血及致死性BM衰竭。虽然启动造血细胞中MF的遗传事件已被充分界定，但我们对BM纤维化相关机制的理解仍不完整。在此，我们证明转录因子EBF1是小鼠和人MSCs中纤维化基因程序的关键调控因子。EBF1在纤维化前MSCs中上调，而MSC特异性敲除Ebf1的小鼠在移植携带骨髓纤维化突变MPLW515L的造血祖细胞后，表现出BM纤维化减轻、髓系细胞扩增减少和脾肿大减轻。此外，我们鉴定出ITGB8是受EBF1调控且具有治疗潜力的基因。

接受ITGB8中和抗体治疗或MSC特异性Itgb8缺失的MF小鼠显示出疾病负担减轻，表现为骨髓纤维化减少、MPL突变细胞频率显著降低以及BM炎症减轻。我们的数据表明，靶向MF微环境中的EBF1-ITGB8轴可能具有治疗益处。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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