C2C12 肌管分化与地塞米松萎缩数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300503

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

骨骼肌萎缩和无力是多种疾病中导致发病、恢复期延长和长期残疾的主要因素。萎缩由肌节蛋白分解引起，导致肌肉质量和力量丧失。肌肉萎缩发生及其进展的分子机制已在患者、小鼠和细胞培养中进行了分析，但这些模型系统的互补性仍有待探索。在此，我们应用深度覆盖的转录组学和蛋白质组学分析，表征了广泛使用的小鼠骨骼肌细胞系C2C12中地塞米松诱导萎缩期间的动态变化。与已发表数据集的比较证实，C2C12肌管很好地再现了肌肉分化。在地塞米松诱导处理下，该模型特别适合捕捉肌节蛋白解体和降解之前的早期萎缩事件。我们还发现了早期肌管萎缩期间线粒体基因表达的改变和差异可变剪接事件。

该数据集补充了现有的体内数据，并为骨骼肌萎缩过程中的调控过程提供了新的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。