人类内源性逆转录病毒驱动早期类风湿关节炎I型干扰素信号激活

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300310

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在早期RA患者的滑膜组织和PBMCs中均观察到HERVs的显著再激活。差异表达的HERVs通过提供顺式调控元件调控邻近ISGs的表达。此外，过量的细胞质HERVs通过dsRNA-RIG-I-IRF3-IFN-I轴触发I型干扰素（IFN-I）应答。靶向内源性逆转录病毒在CIA小鼠模型和RA患者来源的离体模型中均表现出潜在的治疗获益。具体而言，IFN-I诱导型HERV.MLT2B2——一种新型灵长类特异性逆转录元件——作为抗病毒基因IFI44L的关键驱动因子，建立了一个放大IFN-I信号的正反馈环路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。