GSE291978：类风湿关节炎PBMC来源lncRNA的表达及意义

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE291978

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

长链非编码RNA（lncRNA）因其在多种自身免疫性疾病中的关键作用而日益受到关注。本研究通过全面的转录组测序，获取了类风湿关节炎（RA）患者外周血单个核细胞（PBMC）中的lncRNA表达谱。随后，我们采用实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR）对测序数据进行了验证。结果显示，与对照组相比，RA患者PBMC中LINC00494、TSP0AP1-AS1、MCM3AP-AS1和LINC01588水平降低，OIP5-AS1水平升高。对五种失调lncRNA的ROC分析显示，曲线下面积（AUC）范围为0.654至0.915，其联合应用对RA的准确诊断具有较高价值（AUC = 0.920）。RF与LINC00494表达呈负相关（P=0.027），抗CCP与MCM3AP-AS1呈正相关（P=0.024），CRP与LINC01588表达呈负相关（P=0.020）。我们的研究表明，PBMC中的LINC00494、TSP0AP1-AS1、MCM3AP-AS1、LINC01588和OIP5-AS1可能作为RA的生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。