GSE287245：KAT6B缺失导致发育过程中过早骨化并促进成骨细胞分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287245

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

MYST家族组蛋白乙酰转移酶基因KAT6B（MYST4、MORF、QKF）在两种以智力障碍、面部畸形和骨骼异常为特征的不同人类先天性疾病中发生突变，即Ohdo综合征的Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson变异型和生殖髌骨综合征。尽管KAT6B在正常骨骼发育中是必需的，但其在骨骼形成中的细胞和转录效应尚未得到充分研究。在本数据集中，我们检测了KAT6B缺失对增殖中的原代小鼠胚胎成纤维细胞（MEFs）以及被诱导分化为软骨细胞、成骨细胞和脂肪细胞的MEFs中基因表达的影响。我们发现，间充质祖细胞中KAT6B的缺失促进其向成骨细胞祖细胞状态转变，表现为RUNX2（成骨细胞发育的主要调控因子）基因靶标的上调，同时伴有SOX9（软骨细胞发育中的关键基因）的下调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。