I型SMA小鼠模型软骨与骨发育特征数据集

该数据集来自NCBI GEO,标题为I型SMA小鼠模型中软骨与骨发育的特征分析。数据基于SMNdelta7小鼠模型,观察到骨骼尺寸较小、骨谱系基因表达下降,生长板软骨内成骨延迟

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基因组预测GPL2424710090
GSE280223: Characterization of Cartilage and Bone Development in a Mouse model of Type I SMA

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

I型SMA小鼠模型软骨与骨发育特征数据集

Characterization of Cartilage and Bone Development in a Mouse model of Type I SMA

该数据集来自NCBI GEO,标题为I型SMA小鼠模型中软骨与骨发育的特征分析。数据基于SMNdelta7小鼠模型,观察到骨骼尺寸较小、骨谱系基因表达下降,生长板软骨内成骨延迟。研究在E1.5进行转录组评估未见早期变化,而P1给予AAV9-SMN1治疗后,P14及注射后6个月骨与软骨转录组均恢复。数据包含1个文件,为高通量测序表达谱,可用于研究SMA中骨软骨发育异常及基因治疗后的转录组恢复(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 24 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们使用SMNdelta7模型26(FVB.Cg Grm7Tg(SMN2)89Ahmb Smn1tm1Msd Tg(SMN2*delta7)4299Ahmb/J)的数据,观察到骨骼尺寸较小和骨谱系基因表达下降。特别是,生长板软骨显示软骨内成骨延迟。我们随后评估了E1.5时的转录组,但早期未观察到变化。在P1时使用AAV9-SMN1治疗可恢复骨和软骨转录组,在注射后P14和6个月时均如此。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280223

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们使用SMNdelta7模型26(FVB.Cg Grm7Tg(SMN2)89Ahmb Smn1tm1Msd Tg(SMN2*delta7)4299Ahmb/J)的数据显示,我们观察到骨骼尺寸较小以及骨谱系基因表达降低。特别是,生长板软骨显示软骨内成骨延迟。随后我们评估了E1.5时的转录组,但早期未观察到变化。在P1时给予AAV9-SMN1治疗,可在注射后P14和6个月时恢复骨和软骨转录组。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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