镰状细胞病小鼠与人类造血干祖细胞早衰及功能受损研究（人类Bulk RNA-Seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277682

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

使用自体基因修饰造血干/祖细胞（HSPCs）的治愈性疗法现已获FDA批准用于镰状细胞病（SCD）。然而，人们担心SCD的病理生理学可能降低这些细胞疗法所需的HSPCs质量。我们探究了SCD小鼠和个体中HSPCs的表型和功能。我们观察到，SCD小鼠骨髓HSPCs中细胞周期运转增强、DNA损伤、活性氧升高以及衰老标志，这些与长期重建HSPCs的丢失相关。SCD个体的骨髓HSPCs也表现出衰老标志和功能减退。小鼠和人HSPCs的转录组分析显示，调控细胞周期、DNA复制和DNA修复的基因表达降低，与衰老一致。用衰老细胞清除药物ABT-263（Navitoclax）治疗SCD小鼠，增加了HSPC频率，恢复了HSPC移植活性，并减少了伴有DNA损伤的HSPCs数量。因此，我们证明，SCD小鼠和个体骨髓中应激相关的功能丧失可通过衰老细胞清除疗法逆转。

我们的工作提出了一种策略，旨在提升为自体基因治疗采集的造血干/祖细胞（HSPCs）的功能与保真度，这有望进一步增强这些治愈性疗法的有效性和安全性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。