Slc31a1缺失对小鼠骨髓Lin-Sca1+c-Kit细胞基因表达的影响

数据覆盖饮食诱导铜缺乏或造血特异性Slc31a1敲除小鼠的造血干/祖细胞转录组,可用于分析铜转运对造血分化、线粒体功能及相关基因表达调控的作用(来源 NCBI)

geo
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基因组分类GPL2127310090
GSE275365: Effect of Slc31a1 deletion on gene expression of Lin-Sca1+c-Kit  cell in the bone marrow of mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

Slc31a1缺失对小鼠骨髓Lin-Sca1+c-Kit细胞基因表达的影响

Effect of Slc31a1 deletion on gene expression of Lin-Sca1+c-Kit cell in the bone marrow of mice

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE275365_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱技术,研究Slc31a1(Ctr1)缺失对小鼠骨髓Lin-Sca1+c-Kit细胞基因表达的影响。数据覆盖饮食诱导铜缺乏或造血特异性Slc31a1敲除小鼠的造血干/祖细胞转录组,可用于分析铜转运对造血分化、线粒体功能及相关基因表达调控的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):铜稳态与人类健康和造血过程相关。然而,其潜在机制仍不清楚。在此,我们证明了转运蛋白Slc31a1(Ctr1)在出生后造血过程中对铜摄取的关键作用。具体而言,Slc31a1介导的铜转运维持了短期造血干细胞(HSCs)向多能祖细胞的分化和定向。通过转录组分析,我们揭示了来自饮食诱导铜缺乏小鼠或造血特异性Slc31a1敲除(vKO)小鼠的造血干和祖细胞(HSPCs)中分化程序被破坏。此外,我们表明Slc31a1和铜对于通过HSPCs内的复合物IV维持线粒体活性不可或缺。值得注意的是,铜离子载体elesclomol显著改善了vKO小鼠的严重贫血,并部分恢复了线粒体功

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21273、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275365

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

铜稳态与人类健康和造血过程相关。然而,其潜在机制仍不清楚。在此,我们证明了转运蛋白Slc31a1(Ctr1)在出生后造血过程中对铜摄取的关键作用。具体而言,Slc31a1介导的铜转运维持了多能祖细胞从短期造血干细胞(HSCs)的分化和定向。通过转录组分析,我们揭示了来源于饮食诱导的铜缺乏小鼠或造血特异性Slc31a1敲除(vKO)小鼠的造血干/祖细胞(HSPCs)中分化程序被破坏。进一步,我们表明Slc31a1和铜对于通过HSPCs内的复合物IV维持线粒体活性不可或缺。值得注意的是,铜离子载体elesclomol显著改善了vKO小鼠的严重贫血,并部分恢复了vKO HSPCs的线粒体功能。这些发现证明了Slc31a1/铜通过调节线粒体能量代谢在维持HSC稳态中的关键作用;从而揭示了HSC命运决定的分子基础,同时为维持功能性HSCs开辟了新途径。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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