TGF-β刺激的C2C12成肌细胞miRNA表达谱
该数据集为TGF-β刺激后C2C12成肌细胞的miRNA表达谱,采用高通量测序进行非编码RNA分析,平台为GPL17021,物种为小鼠(10090)

基本信息
资源简介
TGF-β刺激的C2C12成肌细胞miRNA表达谱
GSE274814 是一个聚焦于骨骼肌纤维化相关细胞机制的 miRNA 表达谱数据集,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该数据集以小鼠 C2C12 成肌细胞为研究对象,在 TGF-β 刺激条件下开展 miRNA 测序,旨在识别可能参与成肌细胞介导的骨骼肌纤维化过程的潜在靶点。数据采用高通量测序进行非编码 RNA 分析,测序平台为 GPL17021,物种为小鼠(分类编号 10090)。数据集整体归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别,包含 1 个数据文件,即 GSE274814_series_matrix.txt.gz。该资源适合关注非编码 RNA 调控、成肌细胞生物学以及骨骼肌纤维化机制的研究者参考使用。
【数据集背景】
成肌细胞被认为参与骨骼肌纤维化的发生发展。为探索这一过程中的分子调控机制,研究者对成肌细胞施加 TGF-β 刺激,并通过 miRNA 测序来识别可能受其影响或参与调控的潜在靶点。该数据集正是围绕这一实验设计产生的 miRNA 表达谱资源,主题标签包括 Non-coding RNA profiling by high throughput sequencing,说明其核心目标是对非编码 RNA 进行高通量层面的表达分析。数据集所属分类为肌肉骨骼系统疾病 / 其他,提示其应用方向与肌肉骨骼相关疾病机制研究密切相关。
【数据内容】
该数据集的内容为 TGF-β 刺激后 C2C12 成肌细胞的 miRNA 表达谱。数据以高通量测序方式获得,属于非编码 RNA 表达谱分析类型。数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE274814_series_matrix.txt.gz,该文件以 GZIP 压缩包形式提供。主题标签中列出了 GPL17021 与 10090,分别对应测序平台与小鼠物种信息。整体而言,数据内容围绕 miRNA 在成肌细胞受 TGF-β 刺激后的表达变化展开,可用于后续潜在靶点识别与机制探讨。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“miRNA profile of C2C12 myoblasts with TGF-β stimulation”。作者为 Luze,Shi。发布时间为 Aug 14 202。源站描述指出,成肌细胞被认为参与骨骼肌纤维化,本数据集中成肌细胞经 TGF-β 处理后进行 miRNA 测序,以识别潜在靶点。数据集的分类归属为肌肉骨骼系统疾病 / 其他,主题标签涵盖非编码 RNA 高通量测序分析、GPL17021 平台以及小鼠物种编号 10090。以上信息构成了该数据集在采集与来源层面的基本说明。
【适用场景】
该数据集适用于非编码 RNA 表达谱相关研究,尤其是围绕成肌细胞在 TGF-β 刺激条件下 miRNA 变化的分析。潜在应用包括:识别可能参与骨骼肌纤维化过程的 miRNA 潜在靶点;比较刺激前后 miRNA 表达特征;为肌肉骨骼系统疾病相关机制研究提供表达谱层面的参考。由于数据采用高通量测序进行非编码 RNA 分析,平台为 GPL17021,物种为小鼠,因此适合在该平台与物种背景下开展数据探索与验证性分析。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE274814_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按对应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致分析偏差。在确认数据结构与内容后,可结合平台信息 GPL17021 与物种信息 10090 进行后续的 miRNA 表达谱分析。整体流程应遵循先小样本核对、再批量处理的顺序,以保证数据读取与分析的可靠性。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、覆盖度、重复数、标准化方法或批次效应等方面的具体说明。该数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE274814_series_matrix.txt.gz,未提供更多原始数据或补充材料的信息。发布时间为 Aug 14 202,作者为 Luze,Shi。由于缺少质量评估与限制说明,使用者在分析前应自行核对数据完整性与适用性。其他关于质量与限制的内容,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款的具体信息。数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,标题为“miRNA profile of C2C12 myoblasts with TGF-β stimulation”,作者为 Luze,Shi。使用者如需引用或使用该数据,应参考来源站的相关规定。除上述信息外,引用与许可方面的其他内容,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE274814
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
成肌细胞被认为参与骨骼肌纤维化。在本数据集中,成肌细胞经TGF-β处理后进行miRNA测序,以鉴定潜在靶点。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




