PHLPP1在骨髓来源巨噬细胞中的Cut&Tag图谱
实验使用抗PHLPP1抗体对经IL-4刺激4小时的野生型小鼠BMDM进行CUT&Tag分析,细胞纯度>97.5%。数据可用于研究PHLPP1在促纤维化巨噬细胞效应功能相关基因转录调控区域的全局结合与调控作用,支持基因组结合/占据谱分析(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
PHLPP1在骨髓来源巨噬细胞中的Cut&Tag图谱
PHLPP1 Cut&Tag profiling of bone marrow derived macrophage
该数据集为PHLPP1在骨髓来源巨噬细胞(BMDM)中的CUT&Tag测序数据,来源于NCBI GEO(GSE252725)。实验使用抗PHLPP1抗体对经IL-4刺激4小时的野生型小鼠BMDM进行CUT&Tag分析,细胞纯度>97.5%。数据可用于研究PHLPP1在促纤维化巨噬细胞效应功能相关基因转录调控区域的全局结合与调控作用,支持基因组结合/占据谱分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 08 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:为了广泛转录组揭示PHLPP1调控的基因,我们对野生型(WT)BMDM进行了靶向切割与标记(CUT&Tag)分析。方法:小鼠BMDM由骨髓细胞在含重组小鼠M-CSF(20ng/ml)的RPMI-1640培养基中生成。对BMDM进行染色以确认CD11b和F4/80的表面表达。纯度>97.5%的细胞用于后续实验。WT BMDM用IL-4(20ng/ml)刺激4小时。结果:我们使用抗PHLPP1抗体进行了CUT&Tag实验,发现PHLPP1在调控促纤维化巨噬细胞效应功能关键基因的转录调控区域基因方面具有全局影响。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL13112、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252725
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 31 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
目的:为从转录组层面广泛揭示PHLPP1调控的基因,我们对野生型(WT)BMDMs进行了靶向切割与转座(CUT&Tag)分析。方法:小鼠BMDMs由骨髓细胞在含重组小鼠M-CSF(20ng/ml)的RPMI-1640培养基中诱导生成。对BMDMs进行染色以确认CD11b和F4/80的表面表达。纯度>97.5%的细胞用于后续实验。WT BMDMs用IL-4(20ng/ml)刺激4小时。结果:我们使用抗PHLPP1抗体进行了CUT&Tag实验,发现PHLPP1在调控促纤维化巨噬细胞效应功能关键基因的转录调控区域基因方面具有全局性影响。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




