GSE251704:YAP1通过结合MYH9调控免疫性血小板减少症中血小板生成 [scRNA-seq]
该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE251704_series_matrix.txt.gz),主题为免疫性血小板减少症(ITP)中 YAP1 调控血小板生成的单细胞 RNA 测序表达谱
![GSE251704: YAP1 regulates thrombopoiesis by binding to MYH9 in immune thrombocytopenia [scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/161922.jpg)
基本信息
资源简介
GSE251704:YAP1通过结合MYH9调控免疫性血小板减少症中血小板生成 [scRNA-seq]
YAP1 regulates thrombopoiesis by binding to MYH9 in immune thrombocytopenia [scRNA-seq]
该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE251704_series_matrix.txt.gz),主题为免疫性血小板减少症(ITP)中 YAP1 调控血小板生成的单细胞 RNA 测序表达谱。数据聚焦巨核细胞(MKs)在 ITP 中的转录组变化,可用于研究 YAP1 表达降低与细胞骨架肌动蛋白排列异常的关系、GATA1 结合 YAP1 启动子促进巨核细胞成熟,以及磷酸化 YAP1 通过 WW2 结构域结合 MYH9 激活细胞骨架从而促进血小板生成的机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 20 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):免疫性血小板减少症(ITP)是一种以血小板急剧减少为特征的复杂出血性疾病。作为参与 ITP 的主要要素,巨核细胞(MKs)负责血小板生成。然而,ITP 中血小板生成失调背后的机制仍未确定。在本研究中,我们考察了 Yes 相关蛋白 1(YAP1)在 ITP 期间血小板生成中的作用。我们观察到 ITP 患者 MKs 中 YAP1 表达降低并伴有细胞骨架肌动蛋白排列异常。使用实验性 ITP 小鼠,我们表明 YAP1 减少诱导了异常的 MK 分布,降低了晚期 MKs 在总 MKs 中的百分比,并导致次最大程度的血小板恢复。在机制上,GATA1 结合到 YAP1 启动子使其上调,从而促进 MK 成熟。磷酸化的 YAP1 通过其 WW2 结构域与 MYH9 结合,促进细胞骨架激活,从而促进血小板生成。Ta
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE251704
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 07 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
免疫性血小板减少症(ITP)是一种以血小板急剧减少为特征的复杂出血性疾病。作为参与ITP的主要要素,巨核细胞(MKs)负责血小板生成。然而,ITP中血小板生成失调的机制尚未明确。在本研究中,我们探讨了YAP1(Yes相关蛋白1)在ITP期间血小板生成中的作用。我们观察到ITP患者巨核细胞中YAP1表达降低并伴有细胞骨架肌动蛋白排列异常。利用实验性ITP小鼠,我们发现YAP1减少诱导了巨核细胞分布异常,降低了晚期巨核细胞在总巨核细胞中的比例,并导致血小板恢复不足。在机制上,GATA1结合于YAP1启动子而上调YAP1,从而促进巨核细胞成熟。磷酸化的YAP1通过其WW2结构域与MYH9结合,促进细胞骨架活化,从而促进血小板生成。通过YAP1激活剂XMU-MP-1靶向YAP1足以挽救YAP1+/- ITP小鼠和ITP患者的细胞骨架缺陷及血小板生成。
综上所述,这些结果表明YAP1在血小板生成中起着关键作用,为ITP的诊断标志物和治疗方案的开发提供了潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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