ruxolitinib对正常小鼠的毒性

该数据集来自 NCBI GEO(GSE240866),研究 ruxolitinib 对正常小鼠造血系统的毒性。可用于考察 ruxolitinib 对骨髓造血细胞基因表达的影响(来源 NCBI)

geo
浏览 10
基因组分类GPL2424710090
GSE240866: Toxicicty of ruxolitinib in normal mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

ruxolitinib对正常小鼠的毒性

Toxicicty of ruxolitinib in normal mice

该数据集来自 NCBI GEO(GSE240866),研究 ruxolitinib 对正常小鼠造血系统的毒性。实验以含 RUX 饲料喂养小鼠 3 个月,分选处理与未处理小鼠的骨髓 Lin-CD117+ 细胞,使用 SMART-Seq mRNA LP Kit(Takara)和 Illumina Novaseq6000 进行 RNA-Seq 及分析。数据包含 1 个文件(GSE240866_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。可用于考察 ruxolitinib 对骨髓造血细胞基因表达的影响(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景与方法:Ruxolitinib(RUX)是一种 Jak1/2 抑制剂,近期有报道称其可减轻小鼠骨髓衰竭。其在人体中导致贫血和血小板减少的潜在毒性仍令人担忧。我们通过给正常小鼠喂食含 RUX 的饲料 3 个月,测试了 ruxolitinib 对造血的影响。从处理或未处理小鼠中分选骨髓 Lin-CD117+ 细胞。按照本机构方案,使用 SMART-Seq mRNA LP Kit(Takara)和 Illumina Novaseq6000 进行 RNA-Seq 及分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240866

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 08 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240866

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景与方法:据报道,Ruxolitinib(RUX)作为一种Jak1/2抑制剂,近期可减轻小鼠骨髓衰竭。其在人体中可能导致贫血和血小板减少的潜在毒性仍令人担忧。我们通过给正常小鼠喂食含RUX的饲料3个月,测试了ruxolitinib对正常小鼠造血功能的毒性。从处理组或未处理组小鼠中分选骨髓Lin-CD117+细胞。按照本研究所的方案,使用SMART-Seq mRNA LP试剂盒(Takara)和Illumina Novaseq6000进行RNA-Seq及分析。结果:Ruxolitinib降低了正常小鼠的红细胞和淋巴细胞,但未影响中性粒细胞和血小板。RNA测序显示,RUX处理组和未处理组小鼠的HSPC在多维缩放图中转录组分布重叠,表明在分子水平上总体相似。结论:我们的结果表明,ruxolitinib对正常小鼠造血功能的毒性极小。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案