ruxolitinib对正常小鼠的毒性
该数据集来自 NCBI GEO(GSE240866),研究 ruxolitinib 对正常小鼠造血系统的毒性。可用于考察 ruxolitinib 对骨髓造血细胞基因表达的影响(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
ruxolitinib对正常小鼠的毒性
Toxicicty of ruxolitinib in normal mice
该数据集来自 NCBI GEO(GSE240866),研究 ruxolitinib 对正常小鼠造血系统的毒性。实验以含 RUX 饲料喂养小鼠 3 个月,分选处理与未处理小鼠的骨髓 Lin-CD117+ 细胞,使用 SMART-Seq mRNA LP Kit(Takara)和 Illumina Novaseq6000 进行 RNA-Seq 及分析。数据包含 1 个文件(GSE240866_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。可用于考察 ruxolitinib 对骨髓造血细胞基因表达的影响(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 15 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景与方法:Ruxolitinib(RUX)是一种 Jak1/2 抑制剂,近期有报道称其可减轻小鼠骨髓衰竭。其在人体中导致贫血和血小板减少的潜在毒性仍令人担忧。我们通过给正常小鼠喂食含 RUX 的饲料 3 个月,测试了 ruxolitinib 对造血的影响。从处理或未处理小鼠中分选骨髓 Lin-CD117+ 细胞。按照本机构方案,使用 SMART-Seq mRNA LP Kit(Takara)和 Illumina Novaseq6000 进行 RNA-Seq 及分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240866
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 08 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
背景与方法:据报道,Ruxolitinib(RUX)作为一种Jak1/2抑制剂,近期可减轻小鼠骨髓衰竭。其在人体中可能导致贫血和血小板减少的潜在毒性仍令人担忧。我们通过给正常小鼠喂食含RUX的饲料3个月,测试了ruxolitinib对正常小鼠造血功能的毒性。从处理组或未处理组小鼠中分选骨髓Lin-CD117+细胞。按照本研究所的方案,使用SMART-Seq mRNA LP试剂盒(Takara)和Illumina Novaseq6000进行RNA-Seq及分析。结果:Ruxolitinib降低了正常小鼠的红细胞和淋巴细胞,但未影响中性粒细胞和血小板。RNA测序显示,RUX处理组和未处理组小鼠的HSPC在多维缩放图中转录组分布重叠,表明在分子水平上总体相似。结论:我们的结果表明,ruxolitinib对正常小鼠造血功能的毒性极小。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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