多中心Castleman病个体淋巴结空间转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240843

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

特发性多中心Castleman病（iMCD）是一种罕见的由IL-6驱动的血液系统疾病，以全身性淋巴结病、免疫球蛋白水平升高以及骨髓和淋巴结中显著的浆细胞增多为特征。在此，我们报告了一对同卵双胞胎中iMCD的罕见发生。利用单细胞测序，我们鉴定出淋巴结内皮细胞和成纤维细胞网状细胞是IL-6信号的来源。在两名双胞胎中均可见到富含S100A家族基因表达的“炎症性”外周单核细胞增多，而在临床表现较轻的患病双胞胎中，还发现了一群表达细胞毒性基因特征的单核细胞。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。