LSD-1抑制剂RN-1对狒狒红系分化中g-珠蛋白及全局基因表达的影响

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235633

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数据说明

胎儿血红蛋白水平升高可减轻镰状细胞病患者的症状严重程度并降低死亡风险。一种可负担的小分子药物，若能在体内刺激HbF表达，将最适合用于治疗全球大量存在的SCD患者。我们此前的研究表明，给正常狒狒施用LSD1（KDM1A）抑制剂RN-1可升高胎儿血红蛋白（HbF），且在长期治疗期间耐受良好。HbF升高与表观遗传修饰的改变相关，包括γ-珠蛋白启动子处H3K4二甲基化和三甲基化赖氨酸水平升高。尽管在小鼠LSD1基因缺失和沉默模型中已观察到LSD1缺失对造血分化的显著影响，但体内药理学抑制LSD1对造血分化的影响尚不清楚。

这些实验旨在通过以下两方面研究LSD1抑制剂RN-1的体内作用机制：1) 在直接分离自接受RN-1治疗的狒狒、富含不同红系分化阶段的骨髓红系细胞高度纯化亚群中，确定其对γ-珠蛋白表达的影响；2) 在研究原成红细胞高度纯化群体中，探讨RN-1对全局转录组的影响。我们的结果表明，给予狒狒的RN-1作用于红系分化过程中负责γ-珠蛋白抑制的早期事件，并增加有限数量基因的表达，包括参与红系分化的基因如GATA2、GFi-1B和LYN。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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