磷脂酶Cγ1亚型内含子保留现象:魔鬼爪提取物作用机制的细胞与生物信息学研究

研究聚焦磷脂酶C gamma 1亚型的内含子保留现象,以及Harpagophytum procumbens提取物在骨关节炎治疗中的作用机制,采用细胞与生物信息学方法

geo
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基因组分类GPL167919606
GSE234510: Intron retention phenomenon in phospholipase C gamma 1 isoform: how the Harpagophytum procumbens extract works? A cellular and bioionformatic approach.

基本信息

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基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

磷脂酶Cγ1亚型内含子保留现象:魔鬼爪提取物作用机制的细胞与生物信息学研究

Intron retention phenomenon in phospholipase C gamma 1 isoform: how the Harpagophytum procumbens extract works? A cellular and bioionformatic approach.

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE234510_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台为GPL16791。研究聚焦磷脂酶C gamma 1亚型的内含子保留现象,以及Harpagophytum procumbens提取物在骨关节炎治疗中的作用机制,采用细胞与生物信息学方法。数据可用于探索内含子保留相关基因表达模式及天然产物干预下的转录组变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 08 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Harpagophytum procumbens是一种非洲植物,俗称魔鬼爪,自传统医学时代起就被用作治疗骨关节炎(OA)这一最常见关节疾病的天然药物。如今,OA疾病尚无治愈方法;所有疗法都旨在减轻疼痛和炎症,改善患者生活质量。鉴于该病理的广泛性及其在患者中的早期发病,在疾病早期阶段使用天然药物来治疗症状,可以避免长期服用止痛药和抗炎药(这些药物会导致多种副作用),同时取得良好的治疗效果。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234510

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 18 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

Harpagophytum procumbens是一种非洲植物,俗称魔鬼爪,自传统医学时代起就被用作治疗骨关节炎(OA)这一最常见关节疾病的天然药物。如今,OA尚无治愈方法;所有疗法均旨在减轻疼痛和炎症、改善患者生活质量。鉴于该病理的广泛流行及其在患者中的早期发病,使用天然药物治疗疾病早期阶段的症状,可避免长期服用止痛药和抗炎药所导致的多种副作用,同时取得良好的治疗效果。在我们的实验条件下,我们在体外对从接受全膝关节置换手术的OA患者分离的人原代滑膜细胞测试了H. procumbens提取物(HPE)的镇痛和抗炎作用。近年来,我们证明了HPE对内源性大麻素2型受体(CB2)的抗伤害感受作用以及对MAPK通路的抗炎作用,并深入研究了其对多条信号通路的影响。

特别地,对经HPE处理和未经HPE处理的滑膜细胞进行PCR分析后,我们在磷脂酶C γ1酶基因表达上观察到了一个非常有趣的结果。两份样本均显示出两个PCR产物:一个位于300 bp的较低条带,为预期产物;另一个位于500 bp的较高条带,为非预期产物。该实验令人惊讶的结果在于HPE调节这两种PCR产物表达的能力。在未处理样本中,300 bp的产物表达量最高,而HPE处理导致该产物表达下降,同时增加了碱基对数更多的产物的表达。通过Sanger测序分析研究该产物的组成,观察到HPE通过刺激内含子

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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