GSE234339：RIOK3可能调控强直性脊柱炎成骨相关通路及骨髓间充质干细胞分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234339

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数据说明

背景：RNA结合蛋白（RBPs）是基因表达的关键效应分子，在炎症、免疫调节及多种风湿性疾病中发挥重要作用。本研究通过转录组测序筛选强直性脊柱炎（AS）患者与健康对照组之间差异表达的RBPs，并探讨目标RBP在AS患者中的潜在生物学功能及机制。方法：通过RNA-seq获取5例AS患者和3例健康人全血细胞中的差异表达基因（DEGs），并将DEGs与RBPs汇总表取交集获得差异表达的RBPs。选取的目标RBP（RIOK3）在AS患者及年龄、性别匹配对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）中通过qRT-PCR进行验证。随后，采用脂质体转染技术将靶向RIOK3的siRNA转染小鼠骨髓间充质干细胞（mBMSCs），并利用基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对RIOK3调控的DEGs进行分子功能、生物学过程及信号通路富集分析。

通过qRT-PCR检测siRIOK3 mBMSCs中选定基因的表达水平，以进一步验证RIOK3的调控作用。随后，通过慢病毒感染构建RIOK3稳定敲低转染细胞系，成骨诱导21天后通过茜素红染色观察钙沉积，并通过qRT-PCR评估成骨基因ALP、OCN和OPN的表达。结果：RIOK3富集于干扰素相关通路和先天免疫相关通路，是一种重要的免疫调控因子，可影响核糖体功能。RIOK3敲低将抑制mBMSCs中与转录和核糖体功能相关基因的表达，尤其是与成骨分化相关的转录因子，并且还将影响表达

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。