人骨不连组织单细胞RNA测序数据集
该数据集来自NCBI GEO，对一名63岁男性新鲜分离的骨不连组织进行10X Genomics单细胞RNA测序，用于解析非造血组织组成
基本信息
资源简介
人骨不连组织单细胞RNA测序数据集
GSE233676 是一个来自 NCBI GEO 的单细胞转录组数据集，全称为“Single cell RNA-sequencing analysis of human nonunion tissue”，即人骨不连组织的单细胞 RNA 测序分析。该数据集对一名 63 岁男性新鲜分离的骨不连组织进行了 10X Genomics 单细胞 RNA 测序，目的是解析其中非造血组织的细胞组成，并生成一个可与正常骨折组织及骨愈合相关细胞的公开数据集进行比较的数据资源。数据集归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别，包含 1 个文件，样例文件为 GSE233676_series_matrix.txt.gz，作者为 Thomas H Ambrosi，发布时间为 May 30 202，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL24676 平台与物种编号 9606。
【数据集背景】
骨不连是骨折愈合过程失败的一种临床状态，其组织构成与正常骨折愈合组织可能存在差异。为在单细胞分辨率上刻画人骨不连组织的非造血细胞组成，研究者采集了一名 63 岁男性的新鲜骨不连组织，采用 10X Genomics 平台开展单细胞 RNA 测序。该工作的目标并非仅描述单一样本，而是生成一个能够与已公开的正常骨折组织数据集以及骨愈合相关细胞数据进行比较的数据集，从而为理解骨不连的细胞学特征提供参照。数据集由 NCBI GEO 收录，源站标题与数据集英文名一致，分类归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE233676_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。主题标签表明其数据属于“Expression profiling by high throughput sequencing”，涉及平台 GPL24676 和物种编号 9606。源站描述指出，测序对象为新鲜分离的骨不连组织，分析重点在于非造血组织组成。除上述信息外，源站未提供关于细胞数量、基因数量、聚类结果或差异表达分析等更细粒度的内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。样本来自一名 63 岁男性的新鲜分离骨不连组织，采用 10X Genomics 单细胞 RNA 测序技术进行检测。数据集的作者为 Thomas H Ambrosi，发布时间为 May 30 202。源站未提供更详细的样本采集地点、伦理审批信息或组织处理流程。
【适用场景】
该数据集适用于需要考察人骨不连组织非造血细胞组成的单细胞转录组研究场景，也可作为与正常骨折组织及骨愈合相关细胞公开数据集进行比较分析的参考数据。由于源站描述明确其目标是与公开的骨愈合相关数据对照，该数据可用于骨不连与正常愈合过程之间细胞组成差异的探索性分析。源站未提供关于具体分析流程、标准化方法或验证实验的更多信息。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE233676_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。源站未提供关于数据矩阵具体字段含义、注释文件或配套分析代码的进一步说明。
【质量与限制】
该数据集仅基于一名 63 岁男性的骨不连组织，样本量有限，源站未提供重复样本或对照样本的说明。源站未提供测序深度、细胞存活率、数据质控指标等质量相关信息。由于数据仅涉及单一供体，结果的外推需谨慎。源站未提供关于数据更新、版本或已知技术偏差的说明。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款信息。使用时应遵循 NCBI GEO 的通用数据使用规范，具体引用要求需参考源站页面。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE233676
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对一名63岁男性新鲜分离的骨不连组织进行了10X Genomics单细胞RNA测序，以探究非造血组织的组成。目标是生成一个可与正常骨折组织及骨愈合相关细胞的公开可用数据集进行比较的数据集。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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