GSE22965:Ollier病全基因组分析:是否全在基因中?
该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries,标题为Ollier病全基因组分析,探讨该病是否由基因因素主导。可用于研究Ollier病的基因表达特征及相关分子机制(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
GSE22965:Ollier病全基因组分析:是否全在基因中?
GSE22965 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,标题为“Genome-wide analysis of Ollier disease: Is it all in the genes?”,即对 Ollier 病开展的全基因组分析,核心问题是该疾病是否主要由基因因素主导。该数据集归属于肌肉骨骼疾病 / 其他类别,由 Twinkal Chandubhai Pansuriya 提交,发布时间为 201 年 7 月 15 日(原文如此)。数据集以表达谱芯片为主题,涉及 GPL6801 平台与 9606(人类)物种标签,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE22965_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集可用于研究 Ollier 病的基因表达特征及相关分子机制。
【数据集背景】
Ollier 病是一种涉及骨骼发育的疾病,其病因是否以遗传因素为主长期受到关注。该数据集正是围绕这一疑问设计,标题直接提出“Is it all in the genes?”,意在通过全基因组层面的表达分析来考察该病的分子基础。数据集在 GEO 中以 SuperSeries 形式组织,源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的若干 SubSeries 组成,因此其定位是整合多个子系列结果的汇总入口,而非单一实验。该数据集被归入肌肉骨骼疾病 / 其他分类,主题标签为表达谱芯片(Expression profiling by array),指向以微阵列技术测量基因表达的研究路径。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE22965_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。此类文件通常以表格形式组织样本与基因表达测量值,便于后续读取与分析。主题标签中给出的 GPL6801 为芯片平台标识,9606 为人类物种标识,说明数据来自人类样本在 GPL6801 平台上的表达谱检测。关于样本数量、分组设计、具体基因列表及差异表达结果等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI 的 GEO 数据库。提交者为 Twinkal Chandubhai Pansuriya,发布时间为 201 年 7 月 15 日(原文如此,年份信息不完整)。数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述仅说明其由所列 SubSeries 组成,未提供各子系列的具体实验条件、样本来源或处理方式。因此,关于样本采集地点、伦理审批、实验操作流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 Ollier 病的基因表达特征及相关分子机制,可用于在转录组层面考察该疾病是否表现出可归因于基因因素的表达模式。由于主题标签为表达谱芯片,其典型用途包括表达谱数据的重分析、候选基因与通路的探索,以及与其他肌肉骨骼疾病数据集的比较研究。需要说明的是,具体可支持的结论范围受限于数据本身的设计与样本构成,源站未提供相关细节。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE22965_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因编码或字段解析问题导致分析偏差。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时还需注意其与下属 SubSeries 的层级关系,源站描述提示其由若干子系列组成,但未列出具体子系列名称与内容。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,规模有限;发布时间字段中的年份不完整,可能影响时间维度的追溯。作为 SuperSeries,其本身是汇总性条目,具体实验细节分散于下属子系列,而源站未提供这些子系列的详细信息。此外,样本量、平台探针注释版本、数据标准化方法及质控指标等均未在源站描述中给出,使用前应自行核查。以上限制意味着该数据集更适合作为探索性分析的起点,而非直接支撑确定性结论的依据。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI GEO,提交者为 Twinkal Chandubhai Pansuriya。关于引用方式与使用许可的具体条款,源站未提供。使用者在发表研究成果或再分发数据前,应前往源站页面查阅相关的引用要求与使用政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE22965
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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