脓毒症宿主反应失调免疫图谱：高表达CD47的新出现MDSCs通过App-CD74信号抑制B细胞 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222996

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症被定义为由宿主对感染反应失调所致危及生命的器官功能障碍。然而，这种失调如何发生仍不清楚。在此，我们使用scRNA-seq来界定感染的免疫景观，并发现当脓毒症发生时，适应性免疫被急性和强烈抑制，表现为髓源性抑制细胞（MDSCs）数量显著增加、淋巴细胞数量减少以及B细胞相关基因和MHC II类分子表达水平急剧下调。转录组分析显示，系统性免疫抑制不仅发生在外周血中，还发生在所有其他免疫隔室中，包括脾脏、淋巴结和骨髓。在急诊科诊断为感染且适应性免疫相关基因表达水平极低的患者具有发展为脓毒症的高风险。CD47被鉴定为通过诱导淀粉样前体蛋白（App）产生而触发这种免疫抑制的关键分子，App通过抑制B细胞导致适应性免疫抑制。

我们的研究勾勒了一个框架，说明宿主反应失调是如何发生的，并为脓毒症免疫治疗提供了转化机会。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。