NLRC3缺失对LPS处理巨噬细胞糖酵解基因的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE211989

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单核/巨噬细胞有氧糖酵解受损是脓毒症免疫抑制的主要特征。NLRC3作为一种抑制性传感器，可减弱巨噬细胞的Toll样受体4通路，而该通路与脓毒症诱导的免疫抑制相关，但NLRC3是否通过干扰糖酵解在调控巨噬细胞免疫抑制中发挥关键作用仍不清楚。本研究旨在表征NLRC3缺失所致的转录组改变，并进一步探讨糖酵解在脓毒症发展过程中对巨噬细胞的作用。从NLRC3 WT（LysM-Cre-NLRC3fl/fl）和NLRC3ΔMac（LysM-Cre+ NLRC3fl/fl）小鼠的股骨和胫骨中分离骨髓来源巨噬细胞（BMDMs），然后用或不用LPS处理12小时，并使用Illumina 6000对五周龄NLRC3 WT小鼠（WT巨噬细胞）和五周龄NLRC3ΔMac小鼠（NLRC3-/-巨噬细胞）的巨噬细胞mRNA谱进行深度测序，设三个重复。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。