骨髓年龄决定动脉粥样硬化斑块中平滑肌来源细胞克隆性的bulk RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206429

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：本研究旨在探究衰老（18月龄）与年轻（3月龄）骨髓来源单核细胞的基因表达。方法：在冰上以含2%胎牛血清（FBS）的PBS冲洗年轻（3月龄）和衰老（18月龄）小鼠的股骨和胫骨以采集骨髓。使用Lympholyte（Cedarlane，CL0531）通过密度梯度离心从骨髓中分离细胞。以1300 g离心20分钟后，从界面收集骨髓细胞，并在无Ca2+/Mg2+的HBSS中洗涤。通过70 µm尼龙网过滤将细胞解离为单细胞悬液。为分离单核细胞，将骨髓细胞悬液在含0.5% FBS的PBS中用Alexa 700抗CD3（1:100，BioLegend，100215）、PE-Cy7抗CD19（1:100，BioLegend，115520）、FITC抗CD11b（1:100，BD Pharmingen，553310）和APC抗Ly6c抗体（1:100，BioLegend，128015）染色30分钟。使用BD FACSAria细胞分选仪分离CD11b+Ly6c+CD3-CD19-单核细胞。提取总RNA，并使用Illumina HiSeq 2000进行bulk RNA-seq。

结果：比较了从老年（18月龄）和年轻（3月龄）小鼠分离的骨髓来源单核细胞的转录组表达谱。结论：两个年龄组之间的基因表达水平存在显著差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。