免疫性血小板减少症骨髓造血单细胞转录组改变数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE196676),对免疫性血小板减少症(ITP)患者骨髓 CD34+ 造血干/祖细胞进行单细胞转录组测序,旨在解析 ITP 中巨核细胞生成缺陷的转录组改变

基本信息
资源简介
免疫性血小板减少症骨髓造血单细胞转录组改变数据集
Deciphering transcriptome alterations in bone marrow hematopoiesis at single-cell resolution in immune thrombocytopenia
该数据集来自 NCBI GEO(GSE196676),对免疫性血小板减少症(ITP)患者骨髓 CD34+ 造血干/祖细胞进行单细胞转录组测序,旨在解析 ITP 中巨核细胞生成缺陷的转录组改变。数据包含 1 个文件(GSE196676_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台为 GPL24676。可用于研究 ITP 骨髓造血异常及巨核细胞分化相关机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 14 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的与方法:免疫性血小板减少症(ITP)是一种自身免疫性疾病,主要由巨核细胞功能障碍引起,但其潜在机制仍不清楚。在此,我们对骨髓(BM)CD34+ 造血干/祖细胞(HSPC)进行了单细胞转录组分析,以确定 ITP 中巨核细胞生成的缺陷。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196676
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 27 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
目的与方法:免疫性血小板减少症(ITP)是一种自身免疫性疾病,主要由巨核细胞功能障碍引起,但其潜在机制尚不清楚。本研究对骨髓(BM)CD34+造血干/祖细胞(HSPCs)进行了单细胞转录组分析,以确定ITP中巨核细胞生成的缺陷。结果:ITP患者的HSPCs在基因表达、细胞间相互作用和转录调控网络方面存在差异,尤其是在自然杀伤/T细胞祖细胞和一个前B细胞亚群中,突显了与ITP巨核细胞生成缺陷相关的选择性免疫异常。CD9可用于富集偏向巨核细胞分化的HSPCs,CD9+Lin−CD34+CD45RA− HSPCs有望成为ITP的新型诊断和治疗靶点。进一步分析显示,巨核细胞祖细胞(MkP)可分为七个具有不同基因表达模式和功能的亚群。与ITP相关的差异表达基因(DEGs)具有MkP亚型特异性,大多数DEGs集中在具有免疫调节和血小板生成双重功能的亚群中。
结论:本研究全面剖析了造血功能缺陷,并为ITP提供了新的治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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