GSE196347:红系血岛在终末红系造血同时促进粒系造血
该数据集来自NCBI GEO,标题为红系血岛在终末红系造血同时促进粒系造血,包含1个文件GSE196347_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为GPL21103

基本信息
资源简介
GSE196347:红系血岛在终末红系造血同时促进粒系造血
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
该数据集来自NCBI GEO,标题为红系血岛在终末红系造血同时促进粒系造血,包含1个文件GSE196347_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为GPL21103。源站描述显示研究结合多光谱成像流式细胞术、体外血岛重建和梯度沉降富集EBI组分细胞的单细胞RNA-seq,发现EBI中CD11b+细胞为与骨髓EBI巨噬细胞特异关联的中性粒细胞前体,提示红系-(髓系)-母细胞岛是终末粒系造血与红系造血的场所,且谱系平衡受病理生理条件调控。数据可用于研究骨髓红系血岛微环境中红系与粒系造血的动态调控(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 08 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):红系血岛(EBI)由中央巨噬细胞和周围成熟的成红细胞组成,是红系前体细胞的微环境。尽管已有大量研究,其精确组成仍不清楚。利用多光谱成像流式细胞术(IFC)、体外血岛重建以及经梯度沉降富集的EBI组分细胞的单细胞RNA-seq,我们提供证据表明EBI中存在的CD11b+细胞是特异性与骨髓EBI巨噬细胞关联的中性粒细胞前体,这表明红系-(髓系)-母细胞岛是终末粒系造血以及红系造血的场所,并且这些谱系的产生在该微环境内受到动态调控。我们进一步证明,这些谱系之间的平衡由病理生理条件决定,在炎症性贫血期间有利于粒系造血,而在红系造血后有利于红系造血。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21103、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196347
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 25 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
红系血岛(erythroblastic island, EBI)由中央巨噬细胞和周围成熟的成红细胞组成,是红系前体细胞的微环境。尽管已有大量研究,其确切组成仍不清楚。我们采用多光谱成像流式细胞术(IFC)、体外血岛重建以及经梯度沉降富集的EBI组分细胞的单细胞RNA测序,提供证据表明EBI中存在的CD11b+细胞是与骨髓EBI巨噬细胞特异性相关的中性粒细胞前体,提示红系-(髓系)-血岛既是终末粒细胞生成也是红细胞生成的场所,且这些谱系的生产在该微环境中受到动态调控。我们进一步证明,这些谱系之间的平衡由病理生理条件决定,在炎症性贫血时偏向粒细胞生成,而在促红细胞生成素(Epo)刺激后偏向红细胞生成。最后,我们通过对基线和体内Epo刺激后小鼠骨髓EBI进行转录组和表位的细胞索引(CITE)测序,揭示了EBI巨噬细胞的异质性分子图谱。
总之,这些数据表明,EBIs 既作为终末红细胞生成的微环境,又作为粒细胞生成的微环境,发挥双重作用;而中央巨噬细胞则适应应激性红细胞生成以及粒细胞生成的需求。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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