AL淀粉样变性中与淀粉样物产生及Venetoclax敏感性相关的浆细胞功能亚群

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE188222

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数据说明

轻链淀粉样变性（AL）是一种危及生命的浆细胞异常增殖性疾病，表现为由单克隆免疫球蛋白轻链及致病性骨髓浆细胞（BMPCs）产生所导致的多个器官不可逆损伤。尽管AL以单克隆蛋白错误折叠和浆细胞增殖为特征，但AL中BMPCs的功能亚克隆及分子机制仍不明确。此外，AL的个体间异质性决定了化疗反应和轻链的器官趋向性，这需要明确的分子亚型划分。为解决这些问题，我们对来自AL患者、意义未明的单克隆丙种球蛋白病（MGUS）患者及健康对照者捐献的BMPCs进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）。单细胞转录组揭示了骨髓浆细胞（BMPC）功能亚克隆的连续性，勾勒出DNA修复、细胞增殖、免疫球蛋白产生等特征，并呈现信号熵与免疫球蛋白产生的梯度变化。

在富含AL的亚克隆中，淀粉样变性相关基因如淀粉样β结合载脂蛋白E（APOE）、胱抑素3（CST3）和补体C1q A链（C1QA）表达上调。AL中推测的产轻链亚克隆上调了中性粒细胞脱颗粒通路、向高尔基体的运输及高尔基体中的修饰以及天冬酰胺N-连接蛋白糖基化。Cyclin D1（CCND1）hi AL由较大的主亚克隆组成，这些亚克隆高表达Bcl-2复合物和B细胞分化基因，对靶向Bcl-2的venetoclax敏感。CCND1low AL的一个主要亚群携带较大的碳水化合物合成亚克隆，并上调CCND2和淀粉样变性相关基因。总之，我们的结果提供了对AL中BMPCs功能性亚克隆和分子机制的前沿见解，涉及淀粉样变性、轻链产生和venetoclax敏感性，为未来AL发病机制研究提供了知识基础，

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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