GSE179067：免疫细胞监测巨核细胞异常唾液酸化O-聚糖以调节血小板计数

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179067

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数据说明

免疫性血小板减少症（ITP）是儿科患者中常见的血小板疾病。儿童和成人ITP均与唾液酸改变相关，但ITP的病理生理机制仍不明确，且ITP通常是一种排除性诊断。我们对儿童ITP血浆样本的分析显示，抗Thomsen-Friedenreich抗原（TF抗原）抗体表达增加，提示这些患者中通常被唾液酸化且隐蔽的TF抗原暴露增加。O-聚糖唾液酸转移酶St3gal1特异性地在TF抗原上添加唾液酸。为了解TF抗原暴露是否与血小板减少相关，我们构建了巨核细胞（MK）中靶向敲除St3gal1的小鼠模型（St3gal1MK-/-）。TF抗原暴露仅限于巨核细胞，并导致血小板减少。在St3gal1MK-/-小鼠中敲除Jak3可使血小板计数恢复正常，提示免疫细胞参与其中。

产生干扰素的Siglec H阳性骨髓（BM）免疫细胞与O-聚糖唾液酸部分结合，以调节I型干扰素（IFN-I）分泌和血小板释放（血小板生成），这一点由抑制干扰素和Siglec H受体后血小板计数部分恢复正常所证实。单细胞RNA测序确定，MKs暴露TF抗原则使St3gal1MK-/- BM免疫细胞致敏，从而释放IFN-I。单细胞RNA测序进一步揭示了一个新的免疫细胞群体，具有浆细胞样树突状细胞（pDC）样特征，并伴随免疫球蛋白重排基因转录本Igkc和Ighm的上调，提示存在额外的免疫调节机制。因此，在病理状况下常见的异常TF抗原部分可调节BM中的免疫细胞和血小板生成，导致血小板计数减少。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。