STING信号在限制基孔肯雅病毒致病中关键作用的数据集

该数据集来自NCBI GEO,标题为STING信号在限制基孔肯雅病毒致病中的关键作用,包含1个文件GSE159450_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(GPL23479,10090)

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GSE159450: A critical role for STING signaling in limiting pathogenesis of Chikungunya virus

基本信息

模态
时间序列
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分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

STING信号在限制基孔肯雅病毒致病中关键作用的数据集

A critical role for STING signaling in limiting pathogenesis of Chikungunya virus

该数据集来自NCBI GEO,标题为STING信号在限制基孔肯雅病毒致病中的关键作用,包含1个文件GSE159450_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(GPL23479,10090)。研究比较了STING缺陷小鼠与野生型小鼠在基孔肯雅病毒感染后的病毒载量、足部肿胀、关节损伤及免疫细胞浸润等指标,并检测干扰素γ及Cxcl10表达变化。数据可用于研究STING信号在RNA病毒感染及关节炎发病机制中的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):干扰素基因刺激因子(STING)通路同时控制DNA和RNA病毒感染。STING在DNA病毒感染期间对先天免疫反应的诱导至关重要,而其抗RNA病毒的机制仍很大程度上不清楚。我们发现STING信号对于限制基孔肯雅病毒感染和关节炎发病机制至关重要。Sting缺陷小鼠(Stinggt/gt)在整个病毒血症阶段有升高的病毒血症,足部病毒载量短暂升高,同时I型IFN反应正常。Stinggt/gt小鼠表现出比WT小鼠大得多的足部肿胀、关节损伤和免疫细胞浸润。有趣的是,干扰素γ及其诱导的Cxcl10的表达持续上调约7-10倍,并在Stinggt/gt小鼠中随着关节炎进展同步进一步升高。然而,中性粒细胞的趋化吸引剂和激活剂的表达

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL23479、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159450

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 20 202,引用时请注意版本时效。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159450

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

干扰素基因刺激因子(STING)通路同时调控DNA病毒和RNA病毒感染。STING对DNA病毒感染过程中天然免疫应答的诱导至关重要,而其抗RNA病毒的机制在很大程度上仍不明确。我们发现,STING信号对限制基孔肯雅病毒感染及关节炎发病机制具有关键作用。Sting缺陷小鼠(Stinggt/gt)在整个病毒血症期病毒血症水平升高,足部病毒载量短暂升高,同时I型IFN应答正常。与野生型小鼠相比,Stinggt/gt小鼠表现出明显更严重的足部肿胀、关节损伤和免疫细胞浸润。有趣的是,干扰素γ及其诱导的Cxcl10的表达持续上调约7-10倍,并在Stinggt/gt小鼠中随关节炎进展同步进一步升高。然而,中性粒细胞的趋化因子及激活因子Cxcl5、Cxcl7和Cxcr2在Stinggt/gt小鼠关节中的表达受到抑制。这些结果表明,STING缺陷导致异常的趋化因子应答,从而促进CHIKV关节炎的发病机制。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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