GSE157591：MYC促进范可尼贫血中的骨髓干细胞功能障碍

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE157591

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们对范可尼贫血（FA）患者的原代造血干/祖细胞（HSPCs）进行了单细胞转录组（scRNA-seq）分析，以识别导致骨髓衰竭的HSPC损伤的其他决定因素。轨迹分析显示，FA HSPCs的早期造血分化潜能得以保留。正如预期，FA患者HSPCs中p53和TGFβ通路基因过表达。癌基因MYC也被鉴定为FA HSPCs中过表达最高的基因之一。有趣的是，我们观察到FA骨髓中“高TP53”表达HSPCs与“高MYC”表达HSPCs共存。通过BET溴结构域抑制剂(+)-JQ1抑制MYC表达，降低了FA患者原代HSPCs的克隆形成潜能，但挽救了FA小鼠HSPCs的生理/基因毒性应激。“高MYC”表达HSPCs表现出细胞黏附基因（如CXCR4）的显著下调。一致地，FA患者的HSPCs表现出对其骨髓龛黏附缺陷，导致从骨髓迁移至外周血。我们推测MYC过表达损害HSPC功能，并导致FA骨髓中HSPCs耗竭。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。