人类肌生成转录图谱揭示TWIST1在骨骼肌祖细胞维持中的关键作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE129505

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

利用人类多能干细胞（hPSCs）体外衍生人类骨骼肌，为解析肌源性特化过程中关键但尚不为人所充分理解的转录调控机制及其与罕见遗传病的关联开辟了新途径。我们表征了不同人类肌源性阶段的转录图谱，包括OCT4::EGFP+多能干细胞、MSGN1::EGFP+前体节中胚层细胞、PAX7::EGFP+骨骼肌祖细胞、MYOG::EGFP+成肌细胞以及多核肌管。通过无偏聚类分析，我们定义了各细胞群体的特征性基因表达谱，为从未分化hPSCs到完全分化肌管的人类肌生成转录动态提供了独特见解。采用基因敲除策略，我们鉴定出TWIST1是维持人类PAX7::EGFP+推定骨骼肌祖细胞的关键因子，这为罕见遗传病Saethre-Chotzen综合征的肌肉骨骼症状提供了解释。我们的研究为未来识别人类肌源性个体发育调控因子的研究奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。