FGFR2相关颅缝早闭小鼠模型下颌骨发育不良的成骨活性异常数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121780

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

FGFR2基因的突变是多种颅缝早闭综合征的致病原因。这些综合征中的下颌骨形态发育异常在产前阶段鲜有定量描述，其涉及的细胞和分子机制尚不清楚。为探究FGFR2突变对下颌骨发育的影响，研究人员利用与Apert和Crouzon颅缝早闭综合征相关的三种Fgfr2突变品系新生小鼠，采集了微型计算机断层扫描（μCT）图像。通过欧几里得距离矩阵分析和三维μCT图像中相对骨密度（BMD）的分析，揭示了携带Fgfr2突变的小鼠与未受影响的同窝仔鼠在下颌骨形态和骨密度方面存在差异。我们进一步研究了表型最为严重的Fgfr2+/S252W（Fgfr2S252W）小鼠模型中下颌骨发育不良的机制。在胚胎第16.5天（E16.5），Fgfr2S252W胚胎显示成骨原基和Meckel软骨（MC）体积增大，且下颌骨的微结构和矿化相对于未受影响的同窝仔鼠发生了改变。

激光捕获显微切割和RNA-Seq分析揭示了下颌骨的转录组变化，突出表现为参与破骨细胞分化的基因表达增加以及参与骨矿化的基因调控异常。研究证实Fgfr2S252W胚胎下颌骨中破骨细胞活性增强，并发现由于Enpp1和Ank表达上调导致无机焦磷酸盐浓度升高。相反，在E12.5时观察到MC增殖增加。这些发现提供了证据，表明FGFR的功能获得性突变差异性影响真皮骨的膜内成骨和软骨形成，从而参与颅缝早闭综合征中下颌骨形态发生异常。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。