DGCR8稳定异染色质缓解衰老与骨关节炎(RNA-seq)

该数据集来自 NCBI GEO(GSE121029),为高通量 RNA-seq 表达谱数据,聚焦 DGCR8 通过稳定异染色质缓解细胞衰老与骨关节炎的作用

geo
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基因组预测GPL2127310090
GSE121029: Stabilizing Heterochromatin by DGCR8 Alleviates Senescence and Osteoarthritis (RNA-seq)

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

DGCR8稳定异染色质缓解衰老与骨关节炎(RNA-seq)

Stabilizing Heterochromatin by DGCR8 Alleviates Senescence and Osteoarthritis (RNA-seq)

该数据集来自 NCBI GEO(GSE121029),为高通量 RNA-seq 表达谱数据,聚焦 DGCR8 通过稳定异染色质缓解细胞衰老与骨关节炎的作用。数据包含 1 个文件(GSE121029_series_matrix.txt.gz),可用于分析 DGCR8 及其相关异染色质蛋白在衰老与骨关节炎中的表达变化,支持基因表达比较与候选标志物探索(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 09 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):DiGeorge综合征关键区域8(DGCR8)是经典微处理器复合体的关键组分,负责microRNA生物合成。然而,DGCR8的非经典功能尚未被研究。在此,我们证明DGCR8在维持异染色质组织和防止衰老中发挥重要作用。DGCR8的N端截短版本(DR8dex2)加速了人间充质干细胞(hMSCs)的衰老,且不依赖其miRNA加工活性,该活性由其C端结构域介导。进一步研究揭示,DGCR8通过与核膜蛋白Lamin B1以及异染色质相关蛋白KAP1和HP1g相互作用来维持异染色质组织,表达这些蛋白中的任何一种(包括DGCR8)均可逆转DR8dex2 hMSCs的早衰表型。最后,DGCR8在病理性和自然衰老的hM

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21273、10090。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121029

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 06 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DiGeorge综合征关键区域8(DGCR8)是microRNA生物合成中经典微处理器复合体的关键组分。然而,DGCR8的非经典功能尚未被研究。在此,我们证明DGCR8在维持异染色质组织和防止衰老中发挥重要作用。DGCR8的N端截短版本(DR8dex2)可加速人间充质干细胞(hMSCs)的衰老,且该作用不依赖其miRNA加工活性——后者由其C端结构域介导。进一步研究揭示,DGCR8通过与核膜蛋白Lamin B1以及异染色质相关蛋白KAP1和HP1g相互作用来维持异染色质组织,表达这些蛋白中的任何一种(包括DGCR8)均可逆转DR8dex2 hMSCs的早衰表型。最后,DGCR8在病理性和自然衰老的hMSCs中表达下调,而表达DGCR8可减轻小鼠hMSC衰老和骨关节炎。综上所述,这些分析揭示了DGCR8在维持异染色质组织和防止衰老中的一种不依赖miRNA的新功能。

因此,DGCR8可能成为缓解人类衰老相关疾病的新治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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