多发性骨髓瘤基因表达谱验证数据集(INSERM/CHU Montpellier 与 UK Heidelberg)

该数据集来自 omicsdi.org,提供多发性骨髓瘤基因表达谱验证数据,涵盖正常供者、既往未经治疗的 MGUS 与多发性骨髓瘤患者以及骨髓瘤细胞系的 CD138 纯化骨髓浆细胞

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
基因组Gene expression profiling of Multiple Myeloma - Validation, INSERM/CHU Montpellier and UK Heidelberg

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

多发性骨髓瘤基因表达谱验证数据集(INSERM/CHU Montpellier 与 UK Heidelberg)

该数据集为多发性骨髓瘤基因表达谱验证数据集,英文名称为 Gene expression profiling of Multiple Myeloma - Validation, INSERM/CHU Montpellier and UK Heidelberg,来源于 omicsdi.org,在本站归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Transcriptomics。数据集围绕 CD138 纯化骨髓浆细胞的基因表达谱展开,样本覆盖正常供者、既往未经治疗的 MGUS 患者与多发性骨髓瘤患者,以及骨髓瘤细胞系,可用于多发性骨髓瘤及相关前驱病变的转录组层面验证性研究。

【数据集背景】

多发性骨髓瘤是一种起源于骨髓浆细胞的恶性疾病,其发生发展通常经历从正常浆细胞到意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS),再到多发性骨髓瘤的连续过程。在转录组层面比较这些不同阶段样本的基因表达特征,有助于理解疾病进展的分子基础。该数据集定位为多发性骨髓瘤基因表达谱的验证数据集,由 INSERM/CHU Montpellier 与 UK Heidelberg 相关研究工作产生,并通过 omicsdi.org 对外提供。其设计覆盖正常、癌前病变、初治肿瘤及细胞系四类样本,为在多阶段背景下考察浆细胞基因表达变化提供了数据基础。

【数据内容】

数据集的核心内容是 CD138 纯化骨髓浆细胞的基因表达谱。样本类型包括:正常供者的骨髓浆细胞、既往未经治疗的 MGUS 患者的骨髓浆细胞、既往未经治疗的多发性骨髓瘤患者的骨髓浆细胞,以及骨髓瘤细胞系。通过 CD138 纯化富集浆细胞,有助于降低骨髓中其他细胞成分对表达谱的干扰,使测量结果更能反映浆细胞自身的转录状态。数据主题属于转录组学(Transcriptomics),以基因表达谱形式组织。关于具体样本数量、检测平台、基因数量、表达值类型及数据文件格式等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述表明其研究对象为正常供者、既往未经治疗的 MGUS 与多发性骨髓瘤患者以及骨髓瘤细胞系的 CD138 纯化骨髓浆细胞。数据集名称中标注了 INSERM/CHU Montpellier 与 UK Heidelberg,提示数据与这两家机构的研究工作相关。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、测序或芯片平台型号、数据处理管线等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的转录组研究场景,例如:比较正常供者、MGUS 与多发性骨髓瘤样本之间的基因表达差异;考察疾病进展不同阶段的表达特征;将骨髓瘤细胞系的表达谱与患者原代浆细胞样本进行对照;以及作为验证集,对已有基因表达 signature 或候选标志物进行独立验证。由于数据集名称明确包含 Validation,其在研究设计上适合承担验证性分析的角色。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否与某篇具体论文关联,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 omicsdi.org 获取该数据集。使用时可按照样本类型(正常供者、MGUS、多发性骨髓瘤、骨髓瘤细胞系)对样本进行分组,开展差异表达分析、聚类分析或标志物验证分析。由于数据来自 CD138 纯化骨髓浆细胞,分析时应将样本类型作为关键分组变量,并注意细胞系样本与原代样本之间的可比性问题。关于数据下载的具体格式、预处理程度、是否提供标准化表达矩阵以及配套元数据字段等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的一个主要特点是样本覆盖正常、MGUS、初治多发性骨髓瘤及骨髓瘤细胞系等多个类别,且以 CD138 纯化骨髓浆细胞为研究对象,有利于聚焦浆细胞转录组。其定位为验证数据集,适合用于独立验证而非发现性研究的唯一依据。关于样本量、平台分辨率、数据完整性、批次效应控制及质控指标等信息,源站未提供,使用者在解释分析结果时应予以注意。此外,数据集仅涉及转录组层面,不包含基因组、蛋白组或其他组学层面的信息。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始发表文献、数据许可协议及使用条款,源站未提供。使用者在下载和使用数据前,应自行查阅 omicsdi.org 上该数据集条目所附的相关说明,并遵循源站及数据产生机构的要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-363

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gene expression profiling of CD138 purified bone marrow plasma cells of normal donnors, previoulsy untreated MGUS and multiple myeloma patients, and myeloma cell lines

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