原代骨髓来源小鼠巨噬细胞表达谱：未处理及LPS或LPS+PGE处理

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-41833

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

巨噬细胞向抗炎或调节性表型的极化在炎症消退中发挥重要作用。PGE2通过依赖PKA的途径调控巨噬细胞极化。PKA磷酸化SIKs，抑制其在细胞内磷酸化CRTC3的能力。这进而使CRTC3得以转位至细胞核，在那里作为转录因子CREB的共激活因子诱导IL-10转录。与此一致，我们发现遗传学或药理学抑制SIKs均可模拟PGE2对IL-10产生的影响。我们在此表明，PGE2与LPS联合能够促进巨噬细胞呈现调节样表型，其特征为IL-10以及调节性标志物SPHK1和LIGHT的高表达。使用Affymetrix mouse gene 1.1 ST arrays生成了经LPS或LPS+PGE处理的初代骨髓来源小鼠巨噬细胞以及未处理对照的基因表达谱。总共从三组（LPS、LPS+PGE和对照）生成了12张芯片，每组4个重复。LPS组有1个样本因质控问题被剔除，此处提交的是用于我们分析的其余11个样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。