DNMT SNPs 对原发性 ITP DNA 甲基化影响

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源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04100876

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数据说明

疾病：原发性免疫性血小板减少症。免疫性血小板减少症（ITP）是一种免疫介导的获得性疾病，发生于成人和儿童，其特征为血小板计数一过性或持续性降低，并且根据血小板减少的程度，出血风险增加（Rodeghiero等，2009）。国际指南将血小板减少症定义为外周血血小板计数低于100 000/uL（Raj，2017）。在表面健康的人群中，血小板计数常可见于100 000/uL至150 000/uL之间（Adibi等，2007），该阈值降低了对与妊娠相关的轻度“生理性”血小板减少症的担忧（Neunert等，2011）。免疫性血小板减少症可为原发性或继发性。原发性ITP是一种排除性诊断。继发性ITP由基础疾病/状况所致。继发性ITP的病因包括感染（CMV、幽门螺杆菌、HCV、HIV、水痘-带状疱疹病毒）、系统性红斑狼疮、抗磷脂综合征、药物诱导、淋巴增殖性疾病、骨髓移植后及疫苗接种后（Neunert等，2011）。

原发性ITP是一种获得性自身免疫性疾病，既导致血小板破坏增加，又导致血小板生成不足。其发病可能涉及多种机制，包括自身反应性B淋巴细胞、Th1/Tc1极化、T细胞介导的血小板溶解以及循环Treg细胞异常。此外，DNA甲基化可能参与ITP的病理生理过程（Semple et al., 2010, Wang et al., 2011）。DNA甲基化是一种可遗传、稳定且可逆的DNA修饰方式；它能够在不改变核苷酸序列的情况下调控基因表达（Huiyuan et al., 2013）。DNA甲基化由DNA甲基转移酶（DNMTs）介导。DNMT家族有五个成员，包括DNMT3A和DNMT3B（Okano et al., 1999）。DNMT3A和DNMT3B催化从头甲基化，在胚胎内及胎儿发育过程中DNA甲基化模式的建立中具有重要作用（S

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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