DNA甲基化模式变化与SLE双生子不一致性相关

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-19033

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这是自身免疫性疾病DNA甲基化的首次高通量分析。我们使用了一组在三种临床体征常相互重叠的疾病上不一致的同卵双胞胎：系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿关节炎和皮肌炎。只有SLE不一致的同卵双胞胎表现出大量基因DNA甲基化状态的广泛变化。个体分析证实了与SLE发病机制相关基因中存在DNA甲基化和表达变化。我们的发现不仅为SLE患者的临床特征识别了潜在相关的DNA甲基化标志物，还支持了表观遗传变化可能在自身免疫性疾病临床表现中起关键作用的观点。通过标准程序从59份白细胞（WBC）样本中分离的总DNA，这些样本对应于在三种不同自身免疫性疾病上不一致的同卵双胞胎：系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿关节炎（RA）和皮肌炎（DM），以及每对同卵双胞胎的两个额外对照。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。