人唇唾液腺、骨髓和脂肪来源间充质基质细胞的bulk RNA测序

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Afcc6bd827dd39c5daab87163d51508c88200253ce05c96280caac55d58aada83

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们从骨髓（n=3）、脂肪（n=3）和唇唾液腺（n=9）来源的消化人体组织中获取了间充质基质细胞。唾液腺来源的间充质基质细胞分别来自符合2016年ACR/EULAR干燥综合征（SjD）标准的参与者（n=3）、有干眼或口干症状但无系统性自身免疫疾病证据的参与者（n=3），以及无干燥症状的对照参与者（n=3）。样本进行了批量RNA测序。，，# 人唇唾液腺、骨髓和脂肪来源间充质基质细胞的批量RNA测序 数据集DOI：10.5061/dryad.9ghx3ffv6 ## 数据和文件结构描述 我们从骨髓（n=3）、大网膜脂肪（n=3）或唇唾液腺组织（n=9）中采集了组织。组织经消化后，分离、验证并冷冻保存了间充质基质细胞。细胞被送至Novogene。他们使用poly-T寡核苷酸连接的磁珠从总RNA中纯化mRNA，合成cDNA并构建文库。他们使用Qubit和rtPCR对文库进行检测。定量后的文库被合并，并使用Illumina平台进行测序。

他们遵循了标准的生物信息学工作流程，包括生成原始数据、数据质量控制、比对到参考基因组、基因表达定量、差异基因分析以及功能分析。此外，我们提供了包含核苷酸序列和质量评分的FASTQ文件，…

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。