抗原特异性Fab谱分析实现类风湿关节炎人类自身抗体库的分子分辨率

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000093196

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自身抗体的存在是许多自身免疫性疾病的决定性特征。独特自身抗体克隆的数量可以想象受到免疫耐受机制的限制，但由于当前应用技术的局限性而未知。在此，我们以类风湿关节炎（RA）中的抗瓜氨酸化蛋白抗体（ACPA）库为例，介绍一种基于自身抗原特异性液相色谱-质谱联用技术的IgG1 Fab谱分析方法。我们发现每位患者都拥有一个独特且多样的ACPA IgG1库，但仅由少数几个抗体克隆主导。与总血浆IgG1抗体库相比，ACPA IgG1亚库的特征在于携带一个、两个甚至更多Fab聚糖的抗体扩增，并且可检测到同一克隆的不同糖变异体。总之，我们的数据表明，在一种显著的人类自身免疫性疾病中，自身抗体反应是复杂的、每位患者所特有的，并由相对较少的克隆主导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。