再生障碍性贫血患者骨髓与外周血CD45+细胞单细胞V(D)J及5'基因表达数据
该数据集来自 omicsdi.org,包含两名再生障碍性贫血患者的 CD45+ 细胞样本:患者 AA-3 提供 3 份骨髓纵向样本,患者 AA-4 提供 3 份外周血纵向样本

基本信息
资源简介
再生障碍性贫血患者骨髓与外周血CD45+细胞单细胞V(D)J及5'基因表达数据
该数据集收录于 omicsdi.org,英文名称为 7a94d94b-e8e7-425a-b7da-a889c4220cc9 - samples,在本站分类中归属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他,主题标签为 Genomics。数据集围绕再生障碍性贫血患者展开,采用 Chromium V(D)J 与 5' 基因表达平台(10X Genomics)进行检测,研究对象为两名患者的 CD45+ 细胞。其中,患者 AA-3 提供 3 份来自骨髓的纵向样本,患者 AA-4 提供 3 份来自外周血的纵向样本,共计 6 份样本。原始数据通过 Cell Ranger 3.0.1 流程处理。整体而言,该数据集可用于观察再生障碍性贫血患者免疫相关细胞的基因表达与 V(D)J 特征,为相关研究提供样本层面的数据基础。
【数据集背景】
再生障碍性贫血是一种涉及骨髓造血功能异常的疾病,其研究常需要关注免疫细胞组成与基因表达变化。该数据集正是针对再生障碍性贫血患者开展的研究数据,采用 Chromium V(D)J 和 5' 基因表达平台(10X Genomics)进行检测。该平台可用于同时获取基因表达信息与 V(D)J 序列信息,适合对免疫相关细胞群体进行分析。数据集在本站分类中属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他,主题标签为 Genomics,来源站为 omicsdi.org。
【数据内容】
该数据集包含两名再生障碍性贫血患者的 CD45+ 细胞样本。患者 AA-3 提供 3 份纵向样本,来源于骨髓;患者 AA-4 提供 3 份纵向样本,来源于外周血。由此,数据集共涉及 6 份样本,覆盖骨髓与外周血两种样本来源。检测对象为 CD45+ 细胞,这类细胞通常用于免疫相关细胞群体的研究。数据集英文名称为 7a94d94b-e8e7-425a-b7da-a889c4220cc9 - samples。除上述信息外,源站未提供更多关于样本具体分组、细胞数量、测序深度或数据文件构成的内容。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。研究使用 Chromium V(D)J 和 5' 基因表达平台(10X Genomics)对两名再生障碍性贫血患者的 CD45+ 细胞进行分析。患者 AA-3 的样本来自骨髓,共 3 份纵向样本;患者 AA-4 的样本来自外周血,共 3 份纵向样本。原始数据使用 Cell Ranger 3.0.1 流程处理。关于样本采集时间、采集地点、伦理审批信息、患者临床背景等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与再生障碍性贫血相关的基因表达和 V(D)J 分析研究,尤其是针对 CD45+ 细胞的研究。由于样本来自骨髓和外周血,并具有纵向采样特征,可用于比较同一患者不同时间点的样本特征,或用于观察骨髓与外周血来源样本之间的差异。主题标签为 Genomics,表明其可归入基因组学相关分析场景。该数据集也可作为再生障碍性贫血免疫细胞研究的数据参考。但具体分析目标、研究假设和适用疾病亚型,源站未提供。
【使用方法】
该数据集的原始数据通过 Cell Ranger 3.0.1 流程处理。使用时可基于该流程的输出结果开展后续分析。由于数据集涉及 Chromium V(D)J 和 5' 基因表达平台(10X Genomics),分析方向可包括基因表达与 V(D)J 相关特征。样本层面可按患者和来源区分:AA-3 为骨髓来源的 3 份纵向样本,AA-4 为外周血来源的 3 份纵向样本。关于数据下载方式、文件格式、预处理参数、参考基因组版本以及分析软件版本等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含两名患者,分别为 AA-3 和 AA-4,样本总数为 6 份,其中骨髓来源 3 份、外周血来源 3 份。样本量较小,且患者数量有限,可能限制统计推断和泛化能力。数据为纵向样本,但源站未提供采样时间间隔、时间点数量以外的具体信息。原始数据虽经 Cell Ranger 3.0.1 流程处理,但源站未提供质控指标、细胞存活率、测序质量、批次信息或潜在混杂因素。关于数据是否存在缺失、偏差或技术限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、原始文献、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议、使用限制或商业使用条件等,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006937
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用Chromium V(D)J和5’基因表达平台(10X Genomics)对再生障碍性贫血患者进行研究。分析了来自两名患者的CD45+细胞(患者AA-3:来自骨髓的3份纵向样本;患者AA-4:来自外周血的3份纵向样本)。原始数据使用Cell Ranger 3.0.1流程进行处理。
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