再生障碍性贫血骨髓与外周血单细胞多组学数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001012120

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含8批再生障碍性贫血患者的骨髓或外周血细胞，以及健康对照者的骨髓细胞。不同实验条件下的样本已使用Totalseq-C抗体（特征条形码）进行多重标记。如需对样本进行去多重化处理，请参阅10.5281/zenodo.2590196和https://github.com/janihuuh/aa_manu中的说明。每个样本均通过Chromium V(D)J和5’基因表达平台v2（10X Genomics）进行分析。原始数据包括基因表达、特征条形码和V(D)J表达的fastq文件。处理后的数据已存放在EMBL-EBI的ArrayExpress数据库（www.ebi.ac.uk/arrayexpress）中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。