病毒-宿主基因组更新数据集v2
包含58,196条病毒基因组序列与宿主信息，用于研究宿主特异性与人畜共患潜力。
基本信息
模态
基因组
大小
3.28 GB
创建/更新时间
2026-03-31
资源简介
该数据集包含58,196条病毒基因组序列及其宿主信息，提供病毒分类学、宿主、地理数据、分离来源和人畜共患潜力等元数据。数据来源于NCBI Virus和GenBank，经过标准化处理，支持宿主特异性遗传决定因素、人畜共患潜力及基于基因组的分类模型研究。数据分为训练集（52,071条）和测试集（6,125条）。
下载信息
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暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放千方医数集，医疗数据集部分，是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎，并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求，可以和客服联系，或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取与加载（Hugging Face datasets）
# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset
ds = load_dataset("hiyata/Virus-Host-Genomes-updates-v2")
print(ds) # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/hiyata/Virus-Host-Genomes-updates-v2
数据说明
该数据集包含58,196条病毒基因组序列及其宿主信息，提供病毒分类学、宿主、地理数据、分离来源和人畜共患潜力等元数据。数据来源于NCBI Virus和GenBank，经过标准化处理，支持宿主特异性遗传决定因素、人畜共患潜力及基于基因组的分类模型研究。数据分为训练集（52,071条）和测试集（6,125条）。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
完整数据卡：huggingface.co/datasets/hiyata/Virus-Host-Genomes-updates-v2
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