PBMC病毒组检测用于精准医学：体外与体内病毒感染转录组的一致性
包含PBMC体外和体内鼻病毒感染后的基因表达微阵列数据，共8个配对样本，用于个体化病毒反应研究和精准医学病毒组检测。
基本信息
资源简介
PBMC病毒组检测用于精准医学：体外与体内病毒感染转录组的一致性
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 Expression profiling by array、GPL6244、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Towards a PBMC "virogram assay" for precision medicine: concordance between ex vivo and in vivo viral infection transcriptomes》。源站首次发布：Aug 06 201。
【数据内容】
源站原始描述：BACKGROUND: Understanding individual patient host response to viruses is key to designing optimal personalized therapy. Unsurprisingly, in-vivo human experimentation to understand individualized dynamic response of the transcriptome to viruses are rarely studied because of the obvious limitations stemming from ethical considerations of the clinical risk
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：背景：了解单个患者对病毒的宿主反应是设计最佳个体化治疗的关键。不足为奇的是，由于临床风险所带来的伦理考量导致的明显限制，旨在理解转录组对病毒的个体化动态反应的体内人体实验很少被研究。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL6244、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE60153
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 26 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE60153
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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