序贯瓶颈驱动早期急性丙型肝炎病毒感染的病毒进化
该数据集包含通过下一代测序和标准测序技术获取的四名丙型肝炎病毒感染者从急性感染早期到结局的纵向病毒基因序列数据,数据模态为基因序列数据,主要用于研究HCV早期宿主内进化动力学、揭示传播与感染建立过程中的遗传瓶颈事件、分析免疫选择压力下的病毒变异模式,并探索病毒向慢性感染发展的机制。

基本信息
资源简介
序贯瓶颈驱动早期急性丙型肝炎病毒感染的病毒进化
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Sequential Bottlenecks Drive Viral Evolution in Early Acute Hepatitis C Virus Infection》。配套论文《Sequential Bottlenecks Drive Viral Evolution in Early Acute Hepatitis C Virus Infection》发表于 PLoS Pathogens(2011),DOI:10.1371/journal.ppat.1002243。源站首次发布:2011-09-01。
【数据内容】
源站原始描述:Hepatitis C is a pandemic human RNA virus, which commonly causes chronic infection and liver disease. The characterization of viral populations that successfully initiate infection, and also those that drive progression to chronicity is instrumental for understanding pathogenesis and vaccine design. A comprehensive and longitudinal analysis of the viral population was conducted in four subjects followed from very early acute infection to resolution of disease outcome. By means of next generation…
【数据结构与技术规格】
文件数 12 个,合计 36.87 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.ppat.1002243。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences、Cancer、Microbiology、Evolutionary Biology。主题标签:sequential、bottlenecks、viral、acute、hepatitis。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences、Cancer、Microbiology、Evolutionary Biology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Sequential_Bottlenecks_Drive_Viral_Evolution_in_Early_Acute_Hepatitis_C_Virus_Infection/133859
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:A. Bull, Rowena; Luciani, Fabio; McElroy, Kerensa; Gaudieri, Silvana; T. Pham, Son; Chopra, Abha; et al. (2016). Sequential Bottlenecks Drive Viral Evolution in Early Acute Hepatitis C Virus Infection. PLOS Pathogens. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个针对丙型肝炎病毒(HCV)早期感染过程的纵向研究数据集。它通过下一代测序(NGS)和标准克隆/Sanger测序技术,对四名受试者从急性感染早期到疾病结局(痊愈或慢性化)的整个过程中,病毒种群的遗传多样性和病毒变异进行了全面、定量的分析。数据内容包括了低至0.1%频率的病毒变异信息,并通过对重组病毒变体的系统发育分析,揭示了急性感染期由两个连续的瓶颈事件主导的病毒进化模式。该数据集主要用于研究HCV的早期宿主内进化动力学、传播与建立感染的遗传瓶颈、免疫压力下的选择作用,以及理解病毒从急性感染向慢性化发展的机制,对HCV的发病机理研究和疫苗设计具有重要价值。
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