APEX2-MLF2与d133 ORF10免疫沉淀数据集(Table S1,Prophet等)

数据主题为Proteomics,属于感染/病毒感染分类,可用于研究KSHV相关蛋白与宿主细胞的相互作用及Torsin敲除的影响(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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蛋白质Proteomics
APEX2-MLF2 & d133 ORF10 IP (Table S1, Prophet et al.)

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

APEX2-MLF2与d133 ORF10免疫沉淀数据集(Table S1,Prophet等)

APEX2-MLF2 & d133 ORF10 IP (Table S1, Prophet et al.) 是一个以蛋白质组学为主题的数据集,归入感染 / 病毒感染分类,来源于 omicsdi.org。该数据集基于表达 APEX2-MLF2-HA 或 KSHV d133 ORF10 的野生型(WT)或 TorsinKO HeLa 细胞生成,相关数据用于形成 Table S1。从整体上看,这一数据集围绕 KSHV 相关蛋白与宿主细胞之间的相互作用展开,并涉及 Torsin 敲除对这一相互作用体系的影响,适合作为病毒感染与宿主蛋白互作研究中的参考数据资源。

【数据集背景】

该数据集产生于对 KSHV 相关蛋白与宿主细胞相互作用的研究背景。源站描述指出,数据来自表达 APEX2-MLF2-HA 或 d133 ORF10 的 WT 或 TorsinKO HeLa 细胞。这里的实验体系同时涉及两种外源表达构建体(APEX2-MLF2-HA 与 d133 ORF10)以及两种细胞状态(野生型与 Torsin 敲除),说明其设计意图在于比较不同表达条件与不同宿主细胞背景下蛋白相互作用或邻近标记结果的差异。数据集主题标签为 Proteomics,表明其核心内容属于蛋白质组学范畴,服务于对上述体系中蛋白组成或互作关系的系统观察。

【数据内容】

数据集英文名中带有“IP”与“Table S1”字样,源站描述明确说明相关数据用于生成 Table S1。数据由表达 APEX2-MLF2-HA 或 d133 ORF10 的 WT 或 TorsinKO HeLa 细胞产生。除上述信息外,源站未提供关于数据文件格式、样本数量、蛋白鉴定数量、定量指标或表格具体字段的进一步说明。主题标签为 Proteomics,可作为理解数据内容类型的主要依据。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述表明,数据采集基于 WT 或 TorsinKO HeLa 细胞,这些细胞表达 APEX2-MLF2-HA 或 d133 ORF10,其中 d133 ORF10 来自 KSHV。关于具体的样品制备流程、标记或免疫沉淀步骤、质谱平台、仪器参数与采集时间等信息,源站未提供。

【适用场景】

根据其主题与分类,该数据集可用于研究 KSHV 相关蛋白与宿主细胞的相互作用,以及 Torsin 敲除对该相互作用体系的影响。蛋白质组学主题标签表明其适合在蛋白组水平的分析工作中作为数据参考。由于涉及野生型与 Torsin 敲除细胞的对比,也可用于关注宿主因子在病毒感染相关蛋白互作中作用的探索性研究。其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、数据处理流程或分析步骤。使用者如需了解如何读取、处理或复用这些数据,应参考源站及相关发表物中的说明。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、覆盖度、重复数、置信度或技术限制的说明。由于数据仅涉及 WT 与 TorsinKO HeLa 细胞中 APEX2-MLF2-HA 或 d133 ORF10 的表达体系,其适用范围应结合具体研究问题判断;除此之外的质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

数据集名称中提及 Prophet et al. 与 Table S1,可作为引用线索。关于该数据集的许可条款、使用限制与正式引用格式,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000089840

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Datasets generated using WT or TorsinKO HeLa cells expressing APEX2-MLF2-HA or d133 ORF10 from the KSHV. Data were used to generate Table S1.

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