早期急性丙型肝炎病毒感染中驱动病毒进化的连续瓶颈事件数据集

资源简介

该数据集聚焦于丙型肝炎病毒（HCV）在早期急性感染阶段的病毒种群动态与进化机制研究。数据集包含对四名受试者从感染初期至疾病结局（慢性化或清除）的纵向病毒基因序列数据，通过下一代测序（NGS）和标准克隆/Sanger测序技术，量化了低至0.1%频率的病毒变异与遗传多样性。数据揭示了急性感染过程中存在两个连续的瓶颈事件：第一个与传播相关，仅1-2个病毒变体成功建立感染；第二个发生在感染后约100天，表现为病毒多样性下降。在慢性化病例中，第二个瓶颈后出现了源自奠基变体的新病毒种群，并通过少数突变位点的选择性清除发生进化。数据还显示，非同义突变位点的多样性在预测的细胞毒性T细胞表位中更高，提示免疫驱动的进化。该数据集为理解HCV早期感染动力学、病毒进化模式及免疫逃逸机制提供了关键数据，适用于病毒进化生物学、免疫学、疫苗设计及慢性感染机制研究。