马约特岛裂谷热流行病学研究：11年数据的洞见与展望
数据呈现时间序列血清阳性率与年龄分层血清阳性率，可用于分析 RVF 病毒在地方性流行区的传播动态、识别流行期与流行间期，并为预测模型提供输入（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）
基本信息
资源简介
马约特岛裂谷热流行病学研究：11年数据的洞见与展望
The Epidemiology of Rift Valley Fever in Mayotte: Insights and Perspectives from 11 Years of Data
该数据集来自 plos.figshare.com，配套 2016 年发表于 PLOS Neglected Tropical Diseases 的论文，汇集马约特岛 2004–15 年共 11 年家畜血清学调查数据，包含 4 个补充文件（S1–S3 Table、S1 Text）。数据呈现时间序列血清阳性率与年龄分层血清阳性率，可用于分析 RVF 病毒在地方性流行区的传播动态、识别流行期与流行间期，并为预测模型提供输入（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《The Epidemiology of Rift Valley Fever in Mayotte: Insights and Perspectives from 11 Years of Data》发表于 PLOS Neglected Tropical Diseases（2016），DOI：10.1371/journal.pntd.0004783。源站首次发布：2016-06-22。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：裂谷热（RVF）是一种人畜共患的虫媒病毒病，对人类健康、动物健康与生产构成威胁，主要流行于撒哈拉以南非洲。由于数据稀缺，RVF 病毒动态研究不足。在印度洋、非洲东南沿海的马约特岛上，RVF 至少自 2004 年起就已存在。过去十一年（2004–15）开展了多项家畜回顾性与前瞻性血清学调查。这些数据在此汇总并呈现。研究绘制了血清阳性率随时间变化的时间模式以及年龄分层血清阳性率。结果提示 RVF 在 2004–07 年即已存在。2008 至 2010 年间发生了一次流行，IgG 和 IgM 的年峰值患病率分别为 36%（2008–09 年，N = 142，n = 51，95% CI [17–55]）和 41%（N = 96，n = 39，95% CI [25–56]）。该病毒似乎以较低的
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 236.02 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pntd.0004783。
【主题与分类】
源站学科分类：Neuroscience、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：Sub-Saharan Africa、IgM peak、Rift Valley Fever、10 years、rainfall pattern、IgG、age-stratified seroprevalence、insular territory、Temporal patterns、RVF virus dynamics。本站分类：感染/山谷热。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Neuroscience、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_Epidemiology_of_Rift_Valley_Fever_in_Mayotte_Insights_and_Perspectives_from_11_Years_of_Data/3927099
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Métras, Raphaëlle; Cavalerie, Lisa; Dommergues, Laure; Mérot, Philippe; John Edmunds, W.; J. Keeling, Matt; et al. (2016). The Epidemiology of Rift Valley Fever in Mayotte: Insights and Perspectives from 11 Years of Data. PLOS Neglected Tropical Diseases. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
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- 源站标题：The Epidemiology of Rift Valley Fever in Mayotte: Insights and Perspectives from 11 Years of Data
- DOI：10.1371/journal.pntd.0004783
- 发布日期：2016-06-22
- 文件数：4 个
- 文件总体积：236.02 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_Epidemiology_of_Rift_Valley_Fever_in_Mayotte_Insights_and_Perspectives_from_11_Years_of_Data/3927099
命令行下载
curl -L -o "S1 Table.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6145308"
curl -L -o "S2 Table.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6145320"
curl -L -o "S3 Table.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6145329"
curl -L -o "S1 Text.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6145344"
文件清单
S1 Table.PDF（54.70 KB）S2 Table.PDF（84.00 KB）S3 Table.PDF（51.40 KB）S1 Text.PDF（45.90 KB）
文件总体积 236.02 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
裂谷热（RVF）是一种人畜共患的虫媒病毒病，对人类健康、动物健康及畜牧业生产构成威胁，主要流行于撒哈拉以南非洲地区。由于数据匮乏，对裂谷热病毒动态的研究一直较为薄弱。在马约特岛（位于印度洋，非洲东南沿海附近），裂谷热至少自2004年起即已存在。在十一年间（2004—2015年），针对家畜开展了多项回顾性和前瞻性血清学调查。本文对这些数据进行了整理和呈现。将血清流行率的时间模式与时间进行作图，并绘制了按年龄分层的血清流行率。结果表明，裂谷热在2004—2007年间即已存在。2008年至2010年间发生了一次流行，IgG和IgM的年峰值流行率分别为2008—2009年的36%（N = 142，n = 51，95% CI [17–55]）和41%（N = 96，n = 39，95% CI [25–56]）。自2011年以来，病毒似乎以低水平循环，仅造成少量新发感染。2015年，约95%的家畜种群易感（IgG年流行率为6%（N = 584，n = 29，95% CI [3–10]））。月降雨量变化很大（2–540mm），而平均气温则保持较高且变化很小（约25–30°C）。
这一大型数据集是在一个岛屿领地上历时10余年收集的，提示曾发生过一次流行病疫情，目前正处于流行间期，为研究裂谷热（RVF）的动态变化提供了独特的机会。进一步的数据收集和建模工作可用于检验不同的动物输入和降雨模式情景，这些情景或能解释观察到的流行病学模式，并估计潜在疫情再次出现的可能性。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pntd.0004783（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_Epidemiology_of_Rift_Valley_Fever_in_Mayotte_Insights_and_Perspectives_from_11_Years_of_Data/3927099）。
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